Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR2

4930447F04Rik, RIKEN cDNA 4930447F04 gene, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930447F04RikA2AFR2 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
4930447F04RikA2AFR2 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
4930447F04RikA2AFR2 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
4930447F04RikA2AFR2 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
4930447F04RikA2AFR2 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
4930447F04RikA2AFR2 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
4930447F04RikA2AFR2 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
4930447F04RikA2AFR2 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
4930447F04RikA2AFR2 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
4930447F04RikA2AFR2 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC12.07□□□□□ -0.48
4930447F04RikA2AFR2 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
4930447F04RikA2AFR2 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
4930447F04RikA2AFR2 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
4930447F04RikA2AFR2 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
4930447F04RikA2AFR2 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
4930447F04RikA2AFR2 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
4930447F04RikA2AFR2 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
4930447F04RikA2AFR2 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
4930447F04RikA2AFR2 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
4930447F04RikA2AFR2 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
4930447F04RikA2AFR2 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
4930447F04RikA2AFR2 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
4930447F04RikA2AFR2 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
4930447F04RikA2AFR2 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
4930447F04RikA2AFR2 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
4930447F04RikA2AFR2 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
4930447F04RikA2AFR2 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
4930447F04RikA2AFR2 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
4930447F04RikA2AFR2 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
4930447F04RikA2AFR2 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
4930447F04RikA2AFR2 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
4930447F04RikA2AFR2 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
4930447F04RikA2AFR2 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
4930447F04RikA2AFR2 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
4930447F04RikA2AFR2 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
4930447F04RikA2AFR2 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
4930447F04RikA2AFR2 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
4930447F04RikA2AFR2 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
4930447F04RikA2AFR2 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
4930447F04RikA2AFR2 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
4930447F04RikA2AFR2 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
4930447F04RikA2AFR2 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
4930447F04RikA2AFR2 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
4930447F04RikA2AFR2 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
4930447F04RikA2AFR2 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
4930447F04RikA2AFR2 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
4930447F04RikA2AFR2 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
4930447F04RikA2AFR2 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
4930447F04RikA2AFR2 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
4930447F04RikA2AFR2 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
4930447F04RikA2AFR2 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
4930447F04RikA2AFR2 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
4930447F04RikA2AFR2 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
4930447F04RikA2AFR2 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
4930447F04RikA2AFR2 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
4930447F04RikA2AFR2 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
4930447F04RikA2AFR2 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
4930447F04RikA2AFR2 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
4930447F04RikA2AFR2 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
4930447F04RikA2AFR2 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
4930447F04RikA2AFR2 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
4930447F04RikA2AFR2 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
4930447F04RikA2AFR2 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
4930447F04RikA2AFR2 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
4930447F04RikA2AFR2 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
4930447F04RikA2AFR2 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
4930447F04RikA2AFR2 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
4930447F04RikA2AFR2 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
4930447F04RikA2AFR2 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
4930447F04RikA2AFR2 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
4930447F04RikA2AFR2 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
4930447F04RikA2AFR2 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
4930447F04RikA2AFR2 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
4930447F04RikA2AFR2 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
4930447F04RikA2AFR2 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
4930447F04RikA2AFR2 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
4930447F04RikA2AFR2 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
4930447F04RikA2AFR2 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
4930447F04RikA2AFR2 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
4930447F04RikA2AFR2 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
4930447F04RikA2AFR2 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
4930447F04RikA2AFR2 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
4930447F04RikA2AFR2 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
4930447F04RikA2AFR2 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
4930447F04RikA2AFR2 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
4930447F04RikA2AFR2 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
4930447F04RikA2AFR2 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
4930447F04RikA2AFR2 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
4930447F04RikA2AFR2 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
4930447F04RikA2AFR2 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
4930447F04RikA2AFR2 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
4930447F04RikA2AFR2 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
4930447F04RikA2AFR2 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
4930447F04RikA2AFR2 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
4930447F04RikA2AFR2 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
4930447F04RikA2AFR2 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
4930447F04RikA2AFR2 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
4930447F04RikA2AFR2 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
4930447F04RikA2AFR2 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
4930447F04RikA2AFR2 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms