Protein–RNA interactions for Protein: A0JLY1

Ccdc173, Coiled-coil domain-containing protein 173, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc173A0JLY1 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc173A0JLY1 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc173A0JLY1 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc173A0JLY1 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc173A0JLY1 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc173A0JLY1 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc173A0JLY1 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc173A0JLY1 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc173A0JLY1 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc173A0JLY1 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc173A0JLY1 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc173A0JLY1 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc173A0JLY1 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc173A0JLY1 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc173A0JLY1 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc173A0JLY1 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc173A0JLY1 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc173A0JLY1 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc173A0JLY1 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc173A0JLY1 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc173A0JLY1 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc173A0JLY1 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc173A0JLY1 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc173A0JLY1 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc173A0JLY1 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc173A0JLY1 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc173A0JLY1 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc173A0JLY1 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc173A0JLY1 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc173A0JLY1 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc173A0JLY1 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc173A0JLY1 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc173A0JLY1 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc173A0JLY1 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc173A0JLY1 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc173A0JLY1 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc173A0JLY1 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc173A0JLY1 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc173A0JLY1 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc173A0JLY1 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc173A0JLY1 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc173A0JLY1 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc173A0JLY1 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc173A0JLY1 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc173A0JLY1 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc173A0JLY1 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc173A0JLY1 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc173A0JLY1 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc173A0JLY1 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc173A0JLY1 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc173A0JLY1 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc173A0JLY1 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc173A0JLY1 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc173A0JLY1 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc173A0JLY1 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc173A0JLY1 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc173A0JLY1 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc173A0JLY1 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc173A0JLY1 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc173A0JLY1 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc173A0JLY1 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc173A0JLY1 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc173A0JLY1 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc173A0JLY1 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc173A0JLY1 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc173A0JLY1 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc173A0JLY1 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc173A0JLY1 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc173A0JLY1 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc173A0JLY1 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc173A0JLY1 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc173A0JLY1 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc173A0JLY1 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc173A0JLY1 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc173A0JLY1 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ccdc173A0JLY1 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ccdc173A0JLY1 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ccdc173A0JLY1 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc173A0JLY1 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc173A0JLY1 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc173A0JLY1 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc173A0JLY1 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc173A0JLY1 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc173A0JLY1 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc173A0JLY1 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc173A0JLY1 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc173A0JLY1 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc173A0JLY1 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc173A0JLY1 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc173A0JLY1 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc173A0JLY1 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc173A0JLY1 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc173A0JLY1 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc173A0JLY1 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc173A0JLY1 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc173A0JLY1 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc173A0JLY1 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc173A0JLY1 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc173A0JLY1 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc173A0JLY1 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms