Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YYE3

Trbv15, T cell receptor beta, variable 15 (Fragment), mousemouse

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv15A0A0A6YYE3 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv15A0A0A6YYE3 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv15A0A0A6YYE3 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv15A0A0A6YYE3 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv15A0A0A6YYE3 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv15A0A0A6YYE3 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv15A0A0A6YYE3 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv15A0A0A6YYE3 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv15A0A0A6YYE3 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv15A0A0A6YYE3 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv15A0A0A6YYE3 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv15A0A0A6YYE3 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv15A0A0A6YYE3 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv15A0A0A6YYE3 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv15A0A0A6YYE3 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv15A0A0A6YYE3 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv15A0A0A6YYE3 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv15A0A0A6YYE3 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv15A0A0A6YYE3 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv15A0A0A6YYE3 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv15A0A0A6YYE3 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv15A0A0A6YYE3 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv15A0A0A6YYE3 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv15A0A0A6YYE3 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv15A0A0A6YYE3 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv15A0A0A6YYE3 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv15A0A0A6YYE3 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv15A0A0A6YYE3 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv15A0A0A6YYE3 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv15A0A0A6YYE3 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv15A0A0A6YYE3 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv15A0A0A6YYE3 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv15A0A0A6YYE3 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv15A0A0A6YYE3 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv15A0A0A6YYE3 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv15A0A0A6YYE3 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv15A0A0A6YYE3 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv15A0A0A6YYE3 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv15A0A0A6YYE3 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv15A0A0A6YYE3 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv15A0A0A6YYE3 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv15A0A0A6YYE3 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv15A0A0A6YYE3 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv15A0A0A6YYE3 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv15A0A0A6YYE3 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv15A0A0A6YYE3 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv15A0A0A6YYE3 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv15A0A0A6YYE3 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv15A0A0A6YYE3 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv15A0A0A6YYE3 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv15A0A0A6YYE3 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv15A0A0A6YYE3 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv15A0A0A6YYE3 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv15A0A0A6YYE3 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv15A0A0A6YYE3 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv15A0A0A6YYE3 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv15A0A0A6YYE3 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv15A0A0A6YYE3 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv15A0A0A6YYE3 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv15A0A0A6YYE3 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv15A0A0A6YYE3 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv15A0A0A6YYE3 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv15A0A0A6YYE3 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv15A0A0A6YYE3 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv15A0A0A6YYE3 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv15A0A0A6YYE3 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv15A0A0A6YYE3 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv15A0A0A6YYE3 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv15A0A0A6YYE3 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv15A0A0A6YYE3 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv15A0A0A6YYE3 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv15A0A0A6YYE3 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv15A0A0A6YYE3 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv15A0A0A6YYE3 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv15A0A0A6YYE3 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv15A0A0A6YYE3 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv15A0A0A6YYE3 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv15A0A0A6YYE3 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv15A0A0A6YYE3 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv15A0A0A6YYE3 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv15A0A0A6YYE3 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv15A0A0A6YYE3 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv15A0A0A6YYE3 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trbv15A0A0A6YYE3 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trbv15A0A0A6YYE3 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trbv15A0A0A6YYE3 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trbv15A0A0A6YYE3 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trbv15A0A0A6YYE3 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trbv15A0A0A6YYE3 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trbv15A0A0A6YYE3 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trbv15A0A0A6YYE3 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trbv15A0A0A6YYE3 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trbv15A0A0A6YYE3 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trbv15A0A0A6YYE3 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trbv15A0A0A6YYE3 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trbv15A0A0A6YYE3 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trbv15A0A0A6YYE3 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trbv15A0A0A6YYE3 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trbv15A0A0A6YYE3 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Trbv15A0A0A6YYE3 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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