Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2I0

Letm1, Mitochondrial proton/calcium exchanger protein, mousemouse

Predictions only

Length 738 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Letm1Q9Z2I0 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Letm1Q9Z2I0 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Letm1Q9Z2I0 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Letm1Q9Z2I0 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Letm1Q9Z2I0 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Letm1Q9Z2I0 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Letm1Q9Z2I0 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Letm1Q9Z2I0 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Letm1Q9Z2I0 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Letm1Q9Z2I0 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Letm1Q9Z2I0 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Letm1Q9Z2I0 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Letm1Q9Z2I0 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Letm1Q9Z2I0 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Letm1Q9Z2I0 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Letm1Q9Z2I0 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Letm1Q9Z2I0 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Letm1Q9Z2I0 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Letm1Q9Z2I0 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Letm1Q9Z2I0 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Letm1Q9Z2I0 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Letm1Q9Z2I0 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Letm1Q9Z2I0 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Letm1Q9Z2I0 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Letm1Q9Z2I0 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Letm1Q9Z2I0 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Letm1Q9Z2I0 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Letm1Q9Z2I0 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Letm1Q9Z2I0 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Letm1Q9Z2I0 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Letm1Q9Z2I0 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Letm1Q9Z2I0 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Letm1Q9Z2I0 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Letm1Q9Z2I0 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Letm1Q9Z2I0 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Letm1Q9Z2I0 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Letm1Q9Z2I0 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Letm1Q9Z2I0 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Letm1Q9Z2I0 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Letm1Q9Z2I0 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Letm1Q9Z2I0 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Letm1Q9Z2I0 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Letm1Q9Z2I0 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
Letm1Q9Z2I0 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Letm1Q9Z2I0 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Letm1Q9Z2I0 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Letm1Q9Z2I0 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Letm1Q9Z2I0 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Letm1Q9Z2I0 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Letm1Q9Z2I0 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Letm1Q9Z2I0 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Letm1Q9Z2I0 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Letm1Q9Z2I0 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Letm1Q9Z2I0 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Letm1Q9Z2I0 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Letm1Q9Z2I0 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Letm1Q9Z2I0 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Letm1Q9Z2I0 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Letm1Q9Z2I0 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Letm1Q9Z2I0 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Letm1Q9Z2I0 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Letm1Q9Z2I0 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Letm1Q9Z2I0 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Letm1Q9Z2I0 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Letm1Q9Z2I0 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Letm1Q9Z2I0 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Letm1Q9Z2I0 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Letm1Q9Z2I0 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Letm1Q9Z2I0 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Letm1Q9Z2I0 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Letm1Q9Z2I0 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Letm1Q9Z2I0 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Letm1Q9Z2I0 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Letm1Q9Z2I0 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Letm1Q9Z2I0 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Letm1Q9Z2I0 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Letm1Q9Z2I0 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Letm1Q9Z2I0 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Letm1Q9Z2I0 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Letm1Q9Z2I0 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Letm1Q9Z2I0 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Letm1Q9Z2I0 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Letm1Q9Z2I0 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Letm1Q9Z2I0 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Letm1Q9Z2I0 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Letm1Q9Z2I0 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Letm1Q9Z2I0 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Letm1Q9Z2I0 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Letm1Q9Z2I0 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Letm1Q9Z2I0 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Letm1Q9Z2I0 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Letm1Q9Z2I0 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Letm1Q9Z2I0 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Letm1Q9Z2I0 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Letm1Q9Z2I0 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Letm1Q9Z2I0 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Letm1Q9Z2I0 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Letm1Q9Z2I0 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Letm1Q9Z2I0 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Letm1Q9Z2I0 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms