Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T1

Ap3b1, AP-3 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b1Q9Z1T1 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC36,57■■■■□ 3,44
Ap3b1Q9Z1T1 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,57■■■■□ 3,44
Ap3b1Q9Z1T1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36,57■■■■□ 3,44
Ap3b1Q9Z1T1 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,56■■■■□ 3,44
Ap3b1Q9Z1T1 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,56■■■■□ 3,44
Ap3b1Q9Z1T1 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36,56■■■■□ 3,44
Ap3b1Q9Z1T1 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC36,55■■■■□ 3,44
Ap3b1Q9Z1T1 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC36,54■■■■□ 3,44
Ap3b1Q9Z1T1 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,54■■■■□ 3,44
Ap3b1Q9Z1T1 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC36,53■■■■□ 3,44
Ap3b1Q9Z1T1 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC36,53■■■■□ 3,44
Ap3b1Q9Z1T1 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC36,53■■■■□ 3,44
Ap3b1Q9Z1T1 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,53■■■■□ 3,44
Ap3b1Q9Z1T1 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC36,53■■■■□ 3,44
Ap3b1Q9Z1T1 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC36,53■■■■□ 3,44
Ap3b1Q9Z1T1 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC36,51■■■■□ 3,44
Ap3b1Q9Z1T1 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC36,5■■■■□ 3,43
Ap3b1Q9Z1T1 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,5■■■■□ 3,43
Ap3b1Q9Z1T1 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,5■■■■□ 3,43
Ap3b1Q9Z1T1 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC36,5■■■■□ 3,43
Ap3b1Q9Z1T1 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36,49■■■■□ 3,43
Ap3b1Q9Z1T1 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC36,49■■■■□ 3,43
Ap3b1Q9Z1T1 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC36,48■■■■□ 3,43
Ap3b1Q9Z1T1 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,48■■■■□ 3,43
Ap3b1Q9Z1T1 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,47■■■■□ 3,43
Ap3b1Q9Z1T1 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,47■■■■□ 3,43
Ap3b1Q9Z1T1 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC36,46■■■■□ 3,43
Ap3b1Q9Z1T1 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,45■■■■□ 3,43
Ap3b1Q9Z1T1 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC36,45■■■■□ 3,43
Ap3b1Q9Z1T1 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,45■■■■□ 3,43
Ap3b1Q9Z1T1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,45■■■■□ 3,43
Ap3b1Q9Z1T1 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC36,44■■■■□ 3,42
Ap3b1Q9Z1T1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC36,43■■■■□ 3,42
Ap3b1Q9Z1T1 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,42■■■■□ 3,42
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36,42■■■■□ 3,42
Ap3b1Q9Z1T1 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC36,42■■■■□ 3,42
Ap3b1Q9Z1T1 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC36,4■■■■□ 3,42
Ap3b1Q9Z1T1 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36,4■■■■□ 3,42
Ap3b1Q9Z1T1 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36,39■■■■□ 3,42
Ap3b1Q9Z1T1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,38■■■■□ 3,41
Ap3b1Q9Z1T1 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC36,38■■■■□ 3,41
Ap3b1Q9Z1T1 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC36,38■■■■□ 3,41
Ap3b1Q9Z1T1 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC36,38■■■■□ 3,41
Ap3b1Q9Z1T1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36,38■■■■□ 3,41
Ap3b1Q9Z1T1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,37■■■■□ 3,41
Ap3b1Q9Z1T1 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36,37■■■■□ 3,41
Ap3b1Q9Z1T1 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,37■■■■□ 3,41
Ap3b1Q9Z1T1 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC36,36■■■■□ 3,41
Ap3b1Q9Z1T1 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,36■■■■□ 3,41
Ap3b1Q9Z1T1 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,36■■■■□ 3,41
Ap3b1Q9Z1T1 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36,36■■■■□ 3,41
Ap3b1Q9Z1T1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,34■■■■□ 3,41
Ap3b1Q9Z1T1 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC36,33■■■■□ 3,41
Ap3b1Q9Z1T1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,33■■■■□ 3,41
Ap3b1Q9Z1T1 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,32■■■■□ 3,4
Ap3b1Q9Z1T1 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,32■■■■□ 3,4
Ap3b1Q9Z1T1 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36,32■■■■□ 3,4
Ap3b1Q9Z1T1 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC36,31■■■■□ 3,4
Ap3b1Q9Z1T1 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC36,31■■■■□ 3,4
Ap3b1Q9Z1T1 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,28■■■■□ 3,4
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,28■■■■□ 3,4
Ap3b1Q9Z1T1 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC36,27■■■■□ 3,4
Ap3b1Q9Z1T1 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36,27■■■■□ 3,4
Ap3b1Q9Z1T1 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,27■■■■□ 3,4
Ap3b1Q9Z1T1 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC36,27■■■■□ 3,4
Ap3b1Q9Z1T1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC36,27■■■■□ 3,4
Ap3b1Q9Z1T1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,26■■■■□ 3,4
Ap3b1Q9Z1T1 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,26■■■■□ 3,4
Ap3b1Q9Z1T1 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC36,26■■■■□ 3,4
Ap3b1Q9Z1T1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,26■■■■□ 3,39
Ap3b1Q9Z1T1 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,26■■■■□ 3,39
Ap3b1Q9Z1T1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,25■■■■□ 3,39
Ap3b1Q9Z1T1 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC36,25■■■■□ 3,39
Ap3b1Q9Z1T1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36,25■■■■□ 3,39
Ap3b1Q9Z1T1 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,24■■■■□ 3,39
Ap3b1Q9Z1T1 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,23■■■■□ 3,39
Ap3b1Q9Z1T1 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC36,23■■■■□ 3,39
Ap3b1Q9Z1T1 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC36,22■■■■□ 3,39
Ap3b1Q9Z1T1 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36,21■■■■□ 3,39
Ap3b1Q9Z1T1 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,2■■■■□ 3,39
Ap3b1Q9Z1T1 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC36,19■■■■□ 3,38
Ap3b1Q9Z1T1 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC36,19■■■■□ 3,38
Ap3b1Q9Z1T1 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,19■■■■□ 3,38
Ap3b1Q9Z1T1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,19■■■■□ 3,38
Ap3b1Q9Z1T1 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC36,19■■■■□ 3,38
Ap3b1Q9Z1T1 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC36,17■■■■□ 3,38
Ap3b1Q9Z1T1 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36,17■■■■□ 3,38
Ap3b1Q9Z1T1 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36,17■■■■□ 3,38
Ap3b1Q9Z1T1 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC36,17■■■■□ 3,38
Ap3b1Q9Z1T1 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,17■■■■□ 3,38
Ap3b1Q9Z1T1 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC36,17■■■■□ 3,38
Ap3b1Q9Z1T1 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,16■■■■□ 3,38
Ap3b1Q9Z1T1 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,16■■■■□ 3,38
Ap3b1Q9Z1T1 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC36,16■■■■□ 3,38
Ap3b1Q9Z1T1 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC36,16■■■■□ 3,38
Ap3b1Q9Z1T1 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,16■■■■□ 3,38
Ap3b1Q9Z1T1 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,16■■■■□ 3,38
Ap3b1Q9Z1T1 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC36,15■■■■□ 3,38
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,15■■■■□ 3,38
Ap3b1Q9Z1T1 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,15■■■■□ 3,38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19,6 ms