Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T1

Ap3b1, AP-3 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b1Q9Z1T1 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC36.57■■■■□ 3.44
Ap3b1Q9Z1T1 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
Ap3b1Q9Z1T1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.44
Ap3b1Q9Z1T1 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Ap3b1Q9Z1T1 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Ap3b1Q9Z1T1 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
Ap3b1Q9Z1T1 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
Ap3b1Q9Z1T1 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC36.54■■■■□ 3.44
Ap3b1Q9Z1T1 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
Ap3b1Q9Z1T1 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC36.53■■■■□ 3.44
Ap3b1Q9Z1T1 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC36.53■■■■□ 3.44
Ap3b1Q9Z1T1 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
Ap3b1Q9Z1T1 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
Ap3b1Q9Z1T1 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC36.53■■■■□ 3.44
Ap3b1Q9Z1T1 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC36.53■■■■□ 3.44
Ap3b1Q9Z1T1 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC36.51■■■■□ 3.44
Ap3b1Q9Z1T1 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
Ap3b1Q9Z1T1 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
Ap3b1Q9Z1T1 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
Ap3b1Q9Z1T1 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC36.5■■■■□ 3.43
Ap3b1Q9Z1T1 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Ap3b1Q9Z1T1 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC36.49■■■■□ 3.43
Ap3b1Q9Z1T1 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
Ap3b1Q9Z1T1 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
Ap3b1Q9Z1T1 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
Ap3b1Q9Z1T1 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
Ap3b1Q9Z1T1 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
Ap3b1Q9Z1T1 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Ap3b1Q9Z1T1 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC36.45■■■■□ 3.43
Ap3b1Q9Z1T1 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Ap3b1Q9Z1T1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Ap3b1Q9Z1T1 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Ap3b1Q9Z1T1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
Ap3b1Q9Z1T1 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Ap3b1Q9Z1T1 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
Ap3b1Q9Z1T1 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC36.4■■■■□ 3.42
Ap3b1Q9Z1T1 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Ap3b1Q9Z1T1 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Ap3b1Q9Z1T1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Ap3b1Q9Z1T1 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Ap3b1Q9Z1T1 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Ap3b1Q9Z1T1 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Ap3b1Q9Z1T1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Ap3b1Q9Z1T1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Ap3b1Q9Z1T1 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Ap3b1Q9Z1T1 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Ap3b1Q9Z1T1 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
Ap3b1Q9Z1T1 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
Ap3b1Q9Z1T1 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
Ap3b1Q9Z1T1 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
Ap3b1Q9Z1T1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Ap3b1Q9Z1T1 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
Ap3b1Q9Z1T1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
Ap3b1Q9Z1T1 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
Ap3b1Q9Z1T1 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
Ap3b1Q9Z1T1 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.4
Ap3b1Q9Z1T1 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Ap3b1Q9Z1T1 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
Ap3b1Q9Z1T1 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Ap3b1Q9Z1T1 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC36.27■■■■□ 3.4
Ap3b1Q9Z1T1 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Ap3b1Q9Z1T1 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Ap3b1Q9Z1T1 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Ap3b1Q9Z1T1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Ap3b1Q9Z1T1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
Ap3b1Q9Z1T1 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
Ap3b1Q9Z1T1 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
Ap3b1Q9Z1T1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
Ap3b1Q9Z1T1 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
Ap3b1Q9Z1T1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
Ap3b1Q9Z1T1 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC36.25■■■■□ 3.39
Ap3b1Q9Z1T1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
Ap3b1Q9Z1T1 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Ap3b1Q9Z1T1 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Ap3b1Q9Z1T1 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Ap3b1Q9Z1T1 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC36.22■■■■□ 3.39
Ap3b1Q9Z1T1 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
Ap3b1Q9Z1T1 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Ap3b1Q9Z1T1 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC36.19■■■■□ 3.38
Ap3b1Q9Z1T1 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC36.19■■■■□ 3.38
Ap3b1Q9Z1T1 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Ap3b1Q9Z1T1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Ap3b1Q9Z1T1 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC36.19■■■■□ 3.38
Ap3b1Q9Z1T1 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Ap3b1Q9Z1T1 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
Ap3b1Q9Z1T1 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Ap3b1Q9Z1T1 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Ap3b1Q9Z1T1 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Ap3b1Q9Z1T1 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC36.17■■■■□ 3.38
Ap3b1Q9Z1T1 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Ap3b1Q9Z1T1 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Ap3b1Q9Z1T1 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
Ap3b1Q9Z1T1 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Ap3b1Q9Z1T1 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Ap3b1Q9Z1T1 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Ap3b1Q9Z1T1 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Ap3b1Q9Z1T1 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms