Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1A9

Tbc1d8, TBC1 domain family member 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbc1d8Q9Z1A9 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC28,63■■■□□ 2,17
Tbc1d8Q9Z1A9 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC28,62■■■□□ 2,17
Tbc1d8Q9Z1A9 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC28,61■■■□□ 2,17
Tbc1d8Q9Z1A9 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28,61■■■□□ 2,17
Tbc1d8Q9Z1A9 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC28,6■■■□□ 2,17
Tbc1d8Q9Z1A9 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,59■■■□□ 2,17
Tbc1d8Q9Z1A9 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,59■■■□□ 2,17
Tbc1d8Q9Z1A9 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,58■■■□□ 2,17
Tbc1d8Q9Z1A9 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC28,58■■■□□ 2,17
Tbc1d8Q9Z1A9 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,58■■■□□ 2,17
Tbc1d8Q9Z1A9 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28,58■■■□□ 2,17
Tbc1d8Q9Z1A9 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28,58■■■□□ 2,17
Tbc1d8Q9Z1A9 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC28,58■■■□□ 2,17
Tbc1d8Q9Z1A9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,57■■■□□ 2,16
Tbc1d8Q9Z1A9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC28,55■■■□□ 2,16
Tbc1d8Q9Z1A9 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC28,55■■■□□ 2,16
Tbc1d8Q9Z1A9 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,55■■■□□ 2,16
Tbc1d8Q9Z1A9 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,55■■■□□ 2,16
Tbc1d8Q9Z1A9 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,54■■■□□ 2,16
Tbc1d8Q9Z1A9 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC28,54■■■□□ 2,16
Tbc1d8Q9Z1A9 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,52■■■□□ 2,16
Tbc1d8Q9Z1A9 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,52■■■□□ 2,16
Tbc1d8Q9Z1A9 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC28,52■■■□□ 2,16
Tbc1d8Q9Z1A9 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC28,51■■■□□ 2,15
Tbc1d8Q9Z1A9 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28,51■■■□□ 2,15
Tbc1d8Q9Z1A9 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28,5■■■□□ 2,15
Tbc1d8Q9Z1A9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,5■■■□□ 2,15
Tbc1d8Q9Z1A9 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,5■■■□□ 2,15
Tbc1d8Q9Z1A9 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28,49■■■□□ 2,15
Tbc1d8Q9Z1A9 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC28,49■■■□□ 2,15
Tbc1d8Q9Z1A9 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC28,49■■■□□ 2,15
Tbc1d8Q9Z1A9 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,49■■■□□ 2,15
Tbc1d8Q9Z1A9 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,49■■■□□ 2,15
Tbc1d8Q9Z1A9 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,48■■■□□ 2,15
Tbc1d8Q9Z1A9 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC28,48■■■□□ 2,15
Tbc1d8Q9Z1A9 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC28,48■■■□□ 2,15
Tbc1d8Q9Z1A9 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,48■■■□□ 2,15
Tbc1d8Q9Z1A9 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,47■■■□□ 2,15
Tbc1d8Q9Z1A9 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,47■■■□□ 2,15
Tbc1d8Q9Z1A9 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,47■■■□□ 2,15
Tbc1d8Q9Z1A9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28,46■■■□□ 2,15
Tbc1d8Q9Z1A9 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28,45■■■□□ 2,15
Tbc1d8Q9Z1A9 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC28,45■■■□□ 2,14
Tbc1d8Q9Z1A9 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,45■■■□□ 2,14
Tbc1d8Q9Z1A9 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,45■■■□□ 2,14
Tbc1d8Q9Z1A9 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28,42■■■□□ 2,14
Tbc1d8Q9Z1A9 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,42■■■□□ 2,14
Tbc1d8Q9Z1A9 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,42■■■□□ 2,14
Tbc1d8Q9Z1A9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,42■■■□□ 2,14
Tbc1d8Q9Z1A9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC28,42■■■□□ 2,14
Tbc1d8Q9Z1A9 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC28,42■■■□□ 2,14
Tbc1d8Q9Z1A9 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,42■■■□□ 2,14
Tbc1d8Q9Z1A9 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC28,41■■■□□ 2,14
Tbc1d8Q9Z1A9 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC28,4■■■□□ 2,14
Tbc1d8Q9Z1A9 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28,4■■■□□ 2,14
Tbc1d8Q9Z1A9 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC28,39■■■□□ 2,14
Tbc1d8Q9Z1A9 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,39■■■□□ 2,14
Tbc1d8Q9Z1A9 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,39■■■□□ 2,13
Tbc1d8Q9Z1A9 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,39■■■□□ 2,13
Tbc1d8Q9Z1A9 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,38■■■□□ 2,13
Tbc1d8Q9Z1A9 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,38■■■□□ 2,13
Tbc1d8Q9Z1A9 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,37■■■□□ 2,13
Tbc1d8Q9Z1A9 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28,37■■■□□ 2,13
Tbc1d8Q9Z1A9 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC28,36■■■□□ 2,13
Tbc1d8Q9Z1A9 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC28,36■■■□□ 2,13
Tbc1d8Q9Z1A9 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,36■■■□□ 2,13
Tbc1d8Q9Z1A9 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC28,36■■■□□ 2,13
Tbc1d8Q9Z1A9 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,35■■■□□ 2,13
Tbc1d8Q9Z1A9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,35■■■□□ 2,13
Tbc1d8Q9Z1A9 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC28,34■■■□□ 2,13
Tbc1d8Q9Z1A9 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28,34■■■□□ 2,13
Tbc1d8Q9Z1A9 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC28,34■■■□□ 2,13
Tbc1d8Q9Z1A9 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC28,33■■■□□ 2,13
Tbc1d8Q9Z1A9 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28,33■■■□□ 2,13
Tbc1d8Q9Z1A9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC28,33■■■□□ 2,12
Tbc1d8Q9Z1A9 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28,33■■■□□ 2,12
Tbc1d8Q9Z1A9 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,33■■■□□ 2,12
Tbc1d8Q9Z1A9 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,32■■■□□ 2,12
Tbc1d8Q9Z1A9 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC28,32■■■□□ 2,12
Tbc1d8Q9Z1A9 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,31■■■□□ 2,12
Tbc1d8Q9Z1A9 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,31■■■□□ 2,12
Tbc1d8Q9Z1A9 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC28,31■■■□□ 2,12
Tbc1d8Q9Z1A9 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,31■■■□□ 2,12
Tbc1d8Q9Z1A9 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,31■■■□□ 2,12
Tbc1d8Q9Z1A9 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,31■■■□□ 2,12
Tbc1d8Q9Z1A9 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,3■■■□□ 2,12
Tbc1d8Q9Z1A9 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,3■■■□□ 2,12
Tbc1d8Q9Z1A9 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC28,3■■■□□ 2,12
Tbc1d8Q9Z1A9 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,3■■■□□ 2,12
Tbc1d8Q9Z1A9 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC28,29■■■□□ 2,12
Tbc1d8Q9Z1A9 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,28■■■□□ 2,12
Tbc1d8Q9Z1A9 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC28,28■■■□□ 2,12
Tbc1d8Q9Z1A9 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,28■■■□□ 2,12
Tbc1d8Q9Z1A9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC28,28■■■□□ 2,12
Tbc1d8Q9Z1A9 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,27■■■□□ 2,12
Tbc1d8Q9Z1A9 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC28,26■■■□□ 2,12
Tbc1d8Q9Z1A9 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC28,26■■■□□ 2,12
Tbc1d8Q9Z1A9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC28,25■■■□□ 2,11
Tbc1d8Q9Z1A9 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC28,25■■■□□ 2,11
Tbc1d8Q9Z1A9 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC28,25■■■□□ 2,11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13,5 ms