Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZL0

Ripk3, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripk3Q9QZL0 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ripk3Q9QZL0 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ripk3Q9QZL0 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ripk3Q9QZL0 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ripk3Q9QZL0 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ripk3Q9QZL0 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Ripk3Q9QZL0 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ripk3Q9QZL0 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ripk3Q9QZL0 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ripk3Q9QZL0 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ripk3Q9QZL0 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ripk3Q9QZL0 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ripk3Q9QZL0 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ripk3Q9QZL0 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Ripk3Q9QZL0 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ripk3Q9QZL0 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ripk3Q9QZL0 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Ripk3Q9QZL0 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ripk3Q9QZL0 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ripk3Q9QZL0 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ripk3Q9QZL0 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ripk3Q9QZL0 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ripk3Q9QZL0 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ripk3Q9QZL0 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ripk3Q9QZL0 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ripk3Q9QZL0 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ripk3Q9QZL0 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ripk3Q9QZL0 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Ripk3Q9QZL0 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ripk3Q9QZL0 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Ripk3Q9QZL0 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ripk3Q9QZL0 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ripk3Q9QZL0 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ripk3Q9QZL0 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ripk3Q9QZL0 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ripk3Q9QZL0 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ripk3Q9QZL0 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ripk3Q9QZL0 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Ripk3Q9QZL0 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ripk3Q9QZL0 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ripk3Q9QZL0 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ripk3Q9QZL0 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ripk3Q9QZL0 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ripk3Q9QZL0 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ripk3Q9QZL0 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Ripk3Q9QZL0 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Ripk3Q9QZL0 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Ripk3Q9QZL0 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Ripk3Q9QZL0 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ripk3Q9QZL0 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ripk3Q9QZL0 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Ripk3Q9QZL0 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ripk3Q9QZL0 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ripk3Q9QZL0 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ripk3Q9QZL0 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ripk3Q9QZL0 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ripk3Q9QZL0 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ripk3Q9QZL0 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ripk3Q9QZL0 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Ripk3Q9QZL0 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Ripk3Q9QZL0 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ripk3Q9QZL0 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ripk3Q9QZL0 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ripk3Q9QZL0 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ripk3Q9QZL0 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ripk3Q9QZL0 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ripk3Q9QZL0 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ripk3Q9QZL0 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ripk3Q9QZL0 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ripk3Q9QZL0 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ripk3Q9QZL0 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ripk3Q9QZL0 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ripk3Q9QZL0 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ripk3Q9QZL0 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ripk3Q9QZL0 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Ripk3Q9QZL0 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ripk3Q9QZL0 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ripk3Q9QZL0 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ripk3Q9QZL0 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ripk3Q9QZL0 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Ripk3Q9QZL0 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Ripk3Q9QZL0 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ripk3Q9QZL0 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Ripk3Q9QZL0 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ripk3Q9QZL0 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ripk3Q9QZL0 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ripk3Q9QZL0 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ripk3Q9QZL0 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ripk3Q9QZL0 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ripk3Q9QZL0 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ripk3Q9QZL0 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ripk3Q9QZL0 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ripk3Q9QZL0 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ripk3Q9QZL0 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ripk3Q9QZL0 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ripk3Q9QZL0 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ripk3Q9QZL0 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ripk3Q9QZL0 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Ripk3Q9QZL0 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ripk3Q9QZL0 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms