Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ9

Opn4, Melanopsin, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn4Q9QXZ9 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Opn4Q9QXZ9 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Opn4Q9QXZ9 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Opn4Q9QXZ9 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Opn4Q9QXZ9 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Opn4Q9QXZ9 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Opn4Q9QXZ9 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Opn4Q9QXZ9 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Opn4Q9QXZ9 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Opn4Q9QXZ9 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Opn4Q9QXZ9 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Opn4Q9QXZ9 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Opn4Q9QXZ9 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Opn4Q9QXZ9 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Opn4Q9QXZ9 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Opn4Q9QXZ9 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Opn4Q9QXZ9 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Opn4Q9QXZ9 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Opn4Q9QXZ9 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Opn4Q9QXZ9 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Opn4Q9QXZ9 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Opn4Q9QXZ9 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Opn4Q9QXZ9 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Opn4Q9QXZ9 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Opn4Q9QXZ9 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Opn4Q9QXZ9 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Opn4Q9QXZ9 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Opn4Q9QXZ9 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Opn4Q9QXZ9 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Opn4Q9QXZ9 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Opn4Q9QXZ9 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Opn4Q9QXZ9 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Opn4Q9QXZ9 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Opn4Q9QXZ9 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Opn4Q9QXZ9 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Opn4Q9QXZ9 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Opn4Q9QXZ9 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Opn4Q9QXZ9 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Opn4Q9QXZ9 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Opn4Q9QXZ9 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Opn4Q9QXZ9 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Opn4Q9QXZ9 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Opn4Q9QXZ9 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Opn4Q9QXZ9 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Opn4Q9QXZ9 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Opn4Q9QXZ9 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Opn4Q9QXZ9 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Opn4Q9QXZ9 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Opn4Q9QXZ9 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Opn4Q9QXZ9 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Opn4Q9QXZ9 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Opn4Q9QXZ9 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Opn4Q9QXZ9 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Opn4Q9QXZ9 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Opn4Q9QXZ9 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Opn4Q9QXZ9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Opn4Q9QXZ9 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Opn4Q9QXZ9 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Opn4Q9QXZ9 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Opn4Q9QXZ9 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Opn4Q9QXZ9 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Opn4Q9QXZ9 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Opn4Q9QXZ9 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Opn4Q9QXZ9 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Opn4Q9QXZ9 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Opn4Q9QXZ9 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Opn4Q9QXZ9 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Opn4Q9QXZ9 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Opn4Q9QXZ9 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Opn4Q9QXZ9 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Opn4Q9QXZ9 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Opn4Q9QXZ9 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Opn4Q9QXZ9 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Opn4Q9QXZ9 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Opn4Q9QXZ9 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Opn4Q9QXZ9 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Opn4Q9QXZ9 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Opn4Q9QXZ9 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Opn4Q9QXZ9 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Opn4Q9QXZ9 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Opn4Q9QXZ9 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Opn4Q9QXZ9 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Opn4Q9QXZ9 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Opn4Q9QXZ9 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Opn4Q9QXZ9 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Opn4Q9QXZ9 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Opn4Q9QXZ9 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Opn4Q9QXZ9 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Opn4Q9QXZ9 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Opn4Q9QXZ9 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Opn4Q9QXZ9 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Opn4Q9QXZ9 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Opn4Q9QXZ9 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Opn4Q9QXZ9 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Opn4Q9QXZ9 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Opn4Q9QXZ9 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Opn4Q9QXZ9 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Opn4Q9QXZ9 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Opn4Q9QXZ9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Opn4Q9QXZ9 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms