Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8W5

Psmd12, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 12, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd12Q9D8W5 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Psmd12Q9D8W5 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Psmd12Q9D8W5 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Psmd12Q9D8W5 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Psmd12Q9D8W5 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Psmd12Q9D8W5 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Psmd12Q9D8W5 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Psmd12Q9D8W5 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Psmd12Q9D8W5 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Psmd12Q9D8W5 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Psmd12Q9D8W5 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Psmd12Q9D8W5 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Psmd12Q9D8W5 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Psmd12Q9D8W5 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Psmd12Q9D8W5 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Psmd12Q9D8W5 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Psmd12Q9D8W5 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Psmd12Q9D8W5 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Psmd12Q9D8W5 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Psmd12Q9D8W5 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Psmd12Q9D8W5 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Psmd12Q9D8W5 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Psmd12Q9D8W5 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Psmd12Q9D8W5 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Psmd12Q9D8W5 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Psmd12Q9D8W5 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Psmd12Q9D8W5 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Psmd12Q9D8W5 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Psmd12Q9D8W5 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Psmd12Q9D8W5 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Psmd12Q9D8W5 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Psmd12Q9D8W5 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Psmd12Q9D8W5 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Psmd12Q9D8W5 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Psmd12Q9D8W5 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Psmd12Q9D8W5 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Psmd12Q9D8W5 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Psmd12Q9D8W5 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Psmd12Q9D8W5 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Psmd12Q9D8W5 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Psmd12Q9D8W5 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Psmd12Q9D8W5 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Psmd12Q9D8W5 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Psmd12Q9D8W5 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Psmd12Q9D8W5 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Psmd12Q9D8W5 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Psmd12Q9D8W5 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Psmd12Q9D8W5 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Psmd12Q9D8W5 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Psmd12Q9D8W5 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Psmd12Q9D8W5 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Psmd12Q9D8W5 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Psmd12Q9D8W5 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Psmd12Q9D8W5 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Psmd12Q9D8W5 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Psmd12Q9D8W5 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Psmd12Q9D8W5 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Psmd12Q9D8W5 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Psmd12Q9D8W5 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Psmd12Q9D8W5 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Psmd12Q9D8W5 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Psmd12Q9D8W5 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Psmd12Q9D8W5 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Psmd12Q9D8W5 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Psmd12Q9D8W5 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Psmd12Q9D8W5 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Psmd12Q9D8W5 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Psmd12Q9D8W5 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Psmd12Q9D8W5 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Psmd12Q9D8W5 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Psmd12Q9D8W5 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Psmd12Q9D8W5 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Psmd12Q9D8W5 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Psmd12Q9D8W5 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Psmd12Q9D8W5 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Psmd12Q9D8W5 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Psmd12Q9D8W5 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Psmd12Q9D8W5 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Psmd12Q9D8W5 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Psmd12Q9D8W5 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Psmd12Q9D8W5 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Psmd12Q9D8W5 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Psmd12Q9D8W5 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Psmd12Q9D8W5 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Psmd12Q9D8W5 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Psmd12Q9D8W5 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Psmd12Q9D8W5 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Psmd12Q9D8W5 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Psmd12Q9D8W5 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Psmd12Q9D8W5 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Psmd12Q9D8W5 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Psmd12Q9D8W5 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Psmd12Q9D8W5 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Psmd12Q9D8W5 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Psmd12Q9D8W5 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Psmd12Q9D8W5 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Psmd12Q9D8W5 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Psmd12Q9D8W5 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Psmd12Q9D8W5 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Psmd12Q9D8W5 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms