Protein–RNA interactions for Protein: Q9D727

Uncharacterized protein C6orf226 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D727 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9D727 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9D727 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9D727 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9D727 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9D727 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9D727 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Q9D727 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Q9D727 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q9D727 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q9D727 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q9D727 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q9D727 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q9D727 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q9D727 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q9D727 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q9D727 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q9D727 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9D727 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9D727 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9D727 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9D727 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9D727 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9D727 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9D727 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9D727 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9D727 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9D727 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9D727 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9D727 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9D727 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9D727 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9D727 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9D727 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9D727 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9D727 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9D727 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9D727 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9D727 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9D727 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9D727 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q9D727 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q9D727 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q9D727 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q9D727 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q9D727 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q9D727 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9D727 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9D727 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9D727 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9D727 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9D727 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9D727 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9D727 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9D727 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9D727 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9D727 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9D727 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9D727 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9D727 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9D727 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9D727 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9D727 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9D727 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9D727 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9D727 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9D727 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9D727 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9D727 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9D727 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9D727 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9D727 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9D727 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9D727 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Q9D727 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9D727 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9D727 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9D727 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9D727 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9D727 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9D727 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9D727 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9D727 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9D727 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9D727 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9D727 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9D727 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9D727 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9D727 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9D727 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9D727 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9D727 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9D727 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9D727 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9D727 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9D727 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9D727 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9D727 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9D727 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9D727 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms