Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Q4

4930578G10Rik, RIKEN cDNA 4930578G10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930578G10RikQ9D4Q4 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
4930578G10RikQ9D4Q4 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
4930578G10RikQ9D4Q4 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
4930578G10RikQ9D4Q4 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
4930578G10RikQ9D4Q4 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
4930578G10RikQ9D4Q4 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
4930578G10RikQ9D4Q4 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
4930578G10RikQ9D4Q4 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
4930578G10RikQ9D4Q4 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
4930578G10RikQ9D4Q4 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
4930578G10RikQ9D4Q4 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
4930578G10RikQ9D4Q4 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
4930578G10RikQ9D4Q4 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
4930578G10RikQ9D4Q4 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
4930578G10RikQ9D4Q4 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
4930578G10RikQ9D4Q4 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
4930578G10RikQ9D4Q4 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
4930578G10RikQ9D4Q4 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
4930578G10RikQ9D4Q4 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
4930578G10RikQ9D4Q4 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
4930578G10RikQ9D4Q4 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
4930578G10RikQ9D4Q4 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
4930578G10RikQ9D4Q4 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
4930578G10RikQ9D4Q4 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
4930578G10RikQ9D4Q4 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
4930578G10RikQ9D4Q4 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
4930578G10RikQ9D4Q4 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
4930578G10RikQ9D4Q4 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
4930578G10RikQ9D4Q4 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
4930578G10RikQ9D4Q4 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
4930578G10RikQ9D4Q4 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
4930578G10RikQ9D4Q4 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
4930578G10RikQ9D4Q4 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
4930578G10RikQ9D4Q4 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
4930578G10RikQ9D4Q4 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
4930578G10RikQ9D4Q4 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
4930578G10RikQ9D4Q4 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
4930578G10RikQ9D4Q4 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
4930578G10RikQ9D4Q4 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
4930578G10RikQ9D4Q4 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
4930578G10RikQ9D4Q4 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
4930578G10RikQ9D4Q4 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
4930578G10RikQ9D4Q4 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
4930578G10RikQ9D4Q4 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
4930578G10RikQ9D4Q4 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
4930578G10RikQ9D4Q4 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
4930578G10RikQ9D4Q4 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
4930578G10RikQ9D4Q4 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
4930578G10RikQ9D4Q4 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
4930578G10RikQ9D4Q4 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
4930578G10RikQ9D4Q4 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
4930578G10RikQ9D4Q4 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
4930578G10RikQ9D4Q4 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
4930578G10RikQ9D4Q4 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
4930578G10RikQ9D4Q4 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
4930578G10RikQ9D4Q4 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
4930578G10RikQ9D4Q4 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
4930578G10RikQ9D4Q4 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
4930578G10RikQ9D4Q4 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
4930578G10RikQ9D4Q4 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
4930578G10RikQ9D4Q4 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
4930578G10RikQ9D4Q4 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
4930578G10RikQ9D4Q4 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
4930578G10RikQ9D4Q4 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
4930578G10RikQ9D4Q4 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
4930578G10RikQ9D4Q4 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
4930578G10RikQ9D4Q4 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
4930578G10RikQ9D4Q4 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
4930578G10RikQ9D4Q4 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
4930578G10RikQ9D4Q4 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
4930578G10RikQ9D4Q4 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
4930578G10RikQ9D4Q4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
4930578G10RikQ9D4Q4 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
4930578G10RikQ9D4Q4 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
4930578G10RikQ9D4Q4 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
4930578G10RikQ9D4Q4 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
4930578G10RikQ9D4Q4 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
4930578G10RikQ9D4Q4 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
4930578G10RikQ9D4Q4 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms