Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Syf2Q9D198 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Syf2Q9D198 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Syf2Q9D198 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Syf2Q9D198 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Syf2Q9D198 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Syf2Q9D198 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Syf2Q9D198 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Syf2Q9D198 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Syf2Q9D198 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Syf2Q9D198 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Syf2Q9D198 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Syf2Q9D198 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Syf2Q9D198 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Syf2Q9D198 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Syf2Q9D198 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Syf2Q9D198 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Syf2Q9D198 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Syf2Q9D198 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Syf2Q9D198 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Syf2Q9D198 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Syf2Q9D198 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Syf2Q9D198 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Syf2Q9D198 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Syf2Q9D198 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Syf2Q9D198 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Syf2Q9D198 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Syf2Q9D198 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Syf2Q9D198 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Syf2Q9D198 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Syf2Q9D198 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Syf2Q9D198 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Syf2Q9D198 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Syf2Q9D198 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Syf2Q9D198 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Syf2Q9D198 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Syf2Q9D198 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Syf2Q9D198 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Syf2Q9D198 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Syf2Q9D198 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Syf2Q9D198 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Syf2Q9D198 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Syf2Q9D198 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Syf2Q9D198 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Syf2Q9D198 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Syf2Q9D198 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Syf2Q9D198 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Syf2Q9D198 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Syf2Q9D198 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Syf2Q9D198 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Syf2Q9D198 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Syf2Q9D198 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Syf2Q9D198 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Syf2Q9D198 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Syf2Q9D198 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Syf2Q9D198 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Syf2Q9D198 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Syf2Q9D198 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Syf2Q9D198 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Syf2Q9D198 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Syf2Q9D198 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Syf2Q9D198 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Syf2Q9D198 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Syf2Q9D198 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Syf2Q9D198 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Syf2Q9D198 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Syf2Q9D198 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Syf2Q9D198 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Syf2Q9D198 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Syf2Q9D198 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Syf2Q9D198 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Syf2Q9D198 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Syf2Q9D198 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Syf2Q9D198 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Syf2Q9D198 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Syf2Q9D198 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Syf2Q9D198 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Syf2Q9D198 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Syf2Q9D198 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Syf2Q9D198 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Syf2Q9D198 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Syf2Q9D198 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Syf2Q9D198 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Syf2Q9D198 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Syf2Q9D198 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Syf2Q9D198 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Syf2Q9D198 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Syf2Q9D198 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Syf2Q9D198 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Syf2Q9D198 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Syf2Q9D198 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Syf2Q9D198 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Syf2Q9D198 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Syf2Q9D198 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Syf2Q9D198 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Syf2Q9D198 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Syf2Q9D198 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Syf2Q9D198 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Syf2Q9D198 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Syf2Q9D198 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms