Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Zbed3Q9D0L1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Zbed3Q9D0L1 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Zbed3Q9D0L1 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Zbed3Q9D0L1 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Zbed3Q9D0L1 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Zbed3Q9D0L1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Zbed3Q9D0L1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Zbed3Q9D0L1 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Zbed3Q9D0L1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Zbed3Q9D0L1 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Zbed3Q9D0L1 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Zbed3Q9D0L1 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Zbed3Q9D0L1 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Zbed3Q9D0L1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Zbed3Q9D0L1 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Zbed3Q9D0L1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Zbed3Q9D0L1 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Zbed3Q9D0L1 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Zbed3Q9D0L1 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Zbed3Q9D0L1 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Zbed3Q9D0L1 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Zbed3Q9D0L1 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Zbed3Q9D0L1 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Zbed3Q9D0L1 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Zbed3Q9D0L1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Zbed3Q9D0L1 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Zbed3Q9D0L1 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Zbed3Q9D0L1 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Zbed3Q9D0L1 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Zbed3Q9D0L1 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Zbed3Q9D0L1 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Zbed3Q9D0L1 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Zbed3Q9D0L1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Zbed3Q9D0L1 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Zbed3Q9D0L1 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Zbed3Q9D0L1 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Zbed3Q9D0L1 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Zbed3Q9D0L1 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Zbed3Q9D0L1 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Zbed3Q9D0L1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Zbed3Q9D0L1 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Zbed3Q9D0L1 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Zbed3Q9D0L1 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Zbed3Q9D0L1 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Zbed3Q9D0L1 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Zbed3Q9D0L1 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Zbed3Q9D0L1 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Zbed3Q9D0L1 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Zbed3Q9D0L1 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Zbed3Q9D0L1 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Zbed3Q9D0L1 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Zbed3Q9D0L1 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Zbed3Q9D0L1 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Zbed3Q9D0L1 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Zbed3Q9D0L1 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Zbed3Q9D0L1 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Zbed3Q9D0L1 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Zbed3Q9D0L1 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Zbed3Q9D0L1 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Zbed3Q9D0L1 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Zbed3Q9D0L1 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Zbed3Q9D0L1 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Zbed3Q9D0L1 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Zbed3Q9D0L1 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Zbed3Q9D0L1 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Zbed3Q9D0L1 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Zbed3Q9D0L1 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Zbed3Q9D0L1 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Zbed3Q9D0L1 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Zbed3Q9D0L1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Zbed3Q9D0L1 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Zbed3Q9D0L1 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Zbed3Q9D0L1 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Zbed3Q9D0L1 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Zbed3Q9D0L1 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Zbed3Q9D0L1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Zbed3Q9D0L1 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Zbed3Q9D0L1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Zbed3Q9D0L1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Zbed3Q9D0L1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Zbed3Q9D0L1 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Zbed3Q9D0L1 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Zbed3Q9D0L1 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Zbed3Q9D0L1 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Zbed3Q9D0L1 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Zbed3Q9D0L1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Zbed3Q9D0L1 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Zbed3Q9D0L1 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Zbed3Q9D0L1 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Zbed3Q9D0L1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Zbed3Q9D0L1 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Zbed3Q9D0L1 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Zbed3Q9D0L1 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Zbed3Q9D0L1 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Zbed3Q9D0L1 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Zbed3Q9D0L1 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Zbed3Q9D0L1 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Zbed3Q9D0L1 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Zbed3Q9D0L1 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms