Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZP0

Ufsp1, Ufm1-specific protease 1, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufsp1Q9CZP0 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ufsp1Q9CZP0 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ufsp1Q9CZP0 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ufsp1Q9CZP0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ufsp1Q9CZP0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ufsp1Q9CZP0 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ufsp1Q9CZP0 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ufsp1Q9CZP0 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ufsp1Q9CZP0 Cklf-210ENSMUST00000212939 737 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ufsp1Q9CZP0 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ufsp1Q9CZP0 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ufsp1Q9CZP0 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ufsp1Q9CZP0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ufsp1Q9CZP0 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ufsp1Q9CZP0 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ufsp1Q9CZP0 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ufsp1Q9CZP0 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ufsp1Q9CZP0 Gm37965-201ENSMUST00000195304 1362 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ufsp1Q9CZP0 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ufsp1Q9CZP0 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ufsp1Q9CZP0 Irf2-209ENSMUST00000210218 535 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ufsp1Q9CZP0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ufsp1Q9CZP0 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ufsp1Q9CZP0 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ufsp1Q9CZP0 AC154248.2-201ENSMUST00000221964 659 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ufsp1Q9CZP0 Olfr128-201ENSMUST00000080231 1050 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ufsp1Q9CZP0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ufsp1Q9CZP0 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ufsp1Q9CZP0 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ufsp1Q9CZP0 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ufsp1Q9CZP0 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ufsp1Q9CZP0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ufsp1Q9CZP0 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ufsp1Q9CZP0 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ufsp1Q9CZP0 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ufsp1Q9CZP0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ufsp1Q9CZP0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ufsp1Q9CZP0 Gm14363-201ENSMUST00000122304 409 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ufsp1Q9CZP0 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ufsp1Q9CZP0 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ufsp1Q9CZP0 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ufsp1Q9CZP0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ufsp1Q9CZP0 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ufsp1Q9CZP0 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ufsp1Q9CZP0 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ufsp1Q9CZP0 Gm12813-201ENSMUST00000119615 902 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ufsp1Q9CZP0 Gm28745-201ENSMUST00000190069 305 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ufsp1Q9CZP0 Gm44953-201ENSMUST00000208745 1286 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ufsp1Q9CZP0 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ufsp1Q9CZP0 A430010J10Rik-201ENSMUST00000054470 408 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ufsp1Q9CZP0 Prl8a1-201ENSMUST00000006664 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ufsp1Q9CZP0 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ufsp1Q9CZP0 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ufsp1Q9CZP0 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ufsp1Q9CZP0 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ufsp1Q9CZP0 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ufsp1Q9CZP0 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ufsp1Q9CZP0 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ufsp1Q9CZP0 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ufsp1Q9CZP0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ufsp1Q9CZP0 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ufsp1Q9CZP0 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ufsp1Q9CZP0 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ufsp1Q9CZP0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ufsp1Q9CZP0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ufsp1Q9CZP0 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ufsp1Q9CZP0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ufsp1Q9CZP0 AC132260.2-201ENSMUST00000224482 344 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ufsp1Q9CZP0 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ufsp1Q9CZP0 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ufsp1Q9CZP0 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ufsp1Q9CZP0 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ufsp1Q9CZP0 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ufsp1Q9CZP0 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ufsp1Q9CZP0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ufsp1Q9CZP0 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ufsp1Q9CZP0 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ufsp1Q9CZP0 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ufsp1Q9CZP0 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ufsp1Q9CZP0 Gm16701-202ENSMUST00000180995 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ufsp1Q9CZP0 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ufsp1Q9CZP0 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ufsp1Q9CZP0 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ufsp1Q9CZP0 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ufsp1Q9CZP0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ufsp1Q9CZP0 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ufsp1Q9CZP0 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ufsp1Q9CZP0 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ufsp1Q9CZP0 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ufsp1Q9CZP0 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ufsp1Q9CZP0 Gm37592-201ENSMUST00000192741 373 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ufsp1Q9CZP0 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ufsp1Q9CZP0 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ufsp1Q9CZP0 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ufsp1Q9CZP0 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ufsp1Q9CZP0 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ufsp1Q9CZP0 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ufsp1Q9CZP0 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ufsp1Q9CZP0 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ufsp1Q9CZP0 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms