Protein–RNA interactions for Protein: Q9CV82

2310003L06Rik, RIKEN cDNA 2310003L06 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2310003L06RikQ9CV82 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
2310003L06RikQ9CV82 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
2310003L06RikQ9CV82 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
2310003L06RikQ9CV82 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
2310003L06RikQ9CV82 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
2310003L06RikQ9CV82 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
2310003L06RikQ9CV82 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
2310003L06RikQ9CV82 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
2310003L06RikQ9CV82 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
2310003L06RikQ9CV82 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
2310003L06RikQ9CV82 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
2310003L06RikQ9CV82 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
2310003L06RikQ9CV82 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
2310003L06RikQ9CV82 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
2310003L06RikQ9CV82 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
2310003L06RikQ9CV82 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
2310003L06RikQ9CV82 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
2310003L06RikQ9CV82 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
2310003L06RikQ9CV82 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
2310003L06RikQ9CV82 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
2310003L06RikQ9CV82 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
2310003L06RikQ9CV82 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
2310003L06RikQ9CV82 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
2310003L06RikQ9CV82 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
2310003L06RikQ9CV82 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
2310003L06RikQ9CV82 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
2310003L06RikQ9CV82 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
2310003L06RikQ9CV82 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
2310003L06RikQ9CV82 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
2310003L06RikQ9CV82 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
2310003L06RikQ9CV82 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
2310003L06RikQ9CV82 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
2310003L06RikQ9CV82 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
2310003L06RikQ9CV82 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
2310003L06RikQ9CV82 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
2310003L06RikQ9CV82 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
2310003L06RikQ9CV82 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
2310003L06RikQ9CV82 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
2310003L06RikQ9CV82 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
2310003L06RikQ9CV82 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
2310003L06RikQ9CV82 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
2310003L06RikQ9CV82 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
2310003L06RikQ9CV82 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
2310003L06RikQ9CV82 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
2310003L06RikQ9CV82 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
2310003L06RikQ9CV82 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
2310003L06RikQ9CV82 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
2310003L06RikQ9CV82 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
2310003L06RikQ9CV82 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
2310003L06RikQ9CV82 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
2310003L06RikQ9CV82 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
2310003L06RikQ9CV82 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
2310003L06RikQ9CV82 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
2310003L06RikQ9CV82 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
2310003L06RikQ9CV82 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
2310003L06RikQ9CV82 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
2310003L06RikQ9CV82 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
2310003L06RikQ9CV82 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
2310003L06RikQ9CV82 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
2310003L06RikQ9CV82 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
2310003L06RikQ9CV82 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
2310003L06RikQ9CV82 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
2310003L06RikQ9CV82 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
2310003L06RikQ9CV82 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
2310003L06RikQ9CV82 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
2310003L06RikQ9CV82 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
2310003L06RikQ9CV82 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
2310003L06RikQ9CV82 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
2310003L06RikQ9CV82 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
2310003L06RikQ9CV82 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
2310003L06RikQ9CV82 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
2310003L06RikQ9CV82 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
2310003L06RikQ9CV82 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
2310003L06RikQ9CV82 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
2310003L06RikQ9CV82 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
2310003L06RikQ9CV82 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
2310003L06RikQ9CV82 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
2310003L06RikQ9CV82 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
2310003L06RikQ9CV82 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
2310003L06RikQ9CV82 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
2310003L06RikQ9CV82 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
2310003L06RikQ9CV82 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
2310003L06RikQ9CV82 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
2310003L06RikQ9CV82 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
2310003L06RikQ9CV82 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
2310003L06RikQ9CV82 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
2310003L06RikQ9CV82 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
2310003L06RikQ9CV82 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
2310003L06RikQ9CV82 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
2310003L06RikQ9CV82 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
2310003L06RikQ9CV82 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
2310003L06RikQ9CV82 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
2310003L06RikQ9CV82 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
2310003L06RikQ9CV82 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
2310003L06RikQ9CV82 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
2310003L06RikQ9CV82 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
2310003L06RikQ9CV82 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
2310003L06RikQ9CV82 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
2310003L06RikQ9CV82 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
2310003L06RikQ9CV82 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms