Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR26

Vta1, Vacuolar protein sorting-associated protein VTA1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vta1Q9CR26 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Vta1Q9CR26 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Vta1Q9CR26 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Vta1Q9CR26 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Vta1Q9CR26 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Vta1Q9CR26 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Vta1Q9CR26 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Vta1Q9CR26 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Vta1Q9CR26 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Vta1Q9CR26 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Vta1Q9CR26 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Vta1Q9CR26 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Vta1Q9CR26 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Vta1Q9CR26 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Vta1Q9CR26 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Vta1Q9CR26 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Vta1Q9CR26 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Vta1Q9CR26 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Vta1Q9CR26 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Vta1Q9CR26 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Vta1Q9CR26 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Vta1Q9CR26 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Vta1Q9CR26 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Vta1Q9CR26 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Vta1Q9CR26 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Vta1Q9CR26 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Vta1Q9CR26 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Vta1Q9CR26 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Vta1Q9CR26 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Vta1Q9CR26 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Vta1Q9CR26 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Vta1Q9CR26 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Vta1Q9CR26 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Vta1Q9CR26 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Vta1Q9CR26 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Vta1Q9CR26 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Vta1Q9CR26 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Vta1Q9CR26 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Vta1Q9CR26 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Vta1Q9CR26 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Vta1Q9CR26 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Vta1Q9CR26 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Vta1Q9CR26 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Vta1Q9CR26 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Vta1Q9CR26 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Vta1Q9CR26 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Vta1Q9CR26 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Vta1Q9CR26 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Vta1Q9CR26 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Vta1Q9CR26 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Vta1Q9CR26 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Vta1Q9CR26 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Vta1Q9CR26 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Vta1Q9CR26 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Vta1Q9CR26 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Vta1Q9CR26 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Vta1Q9CR26 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Vta1Q9CR26 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Vta1Q9CR26 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Vta1Q9CR26 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Vta1Q9CR26 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Vta1Q9CR26 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Vta1Q9CR26 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Vta1Q9CR26 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Vta1Q9CR26 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Vta1Q9CR26 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Vta1Q9CR26 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Vta1Q9CR26 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Vta1Q9CR26 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Vta1Q9CR26 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Vta1Q9CR26 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Vta1Q9CR26 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Vta1Q9CR26 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Vta1Q9CR26 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Vta1Q9CR26 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Vta1Q9CR26 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Vta1Q9CR26 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Vta1Q9CR26 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Vta1Q9CR26 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Vta1Q9CR26 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Vta1Q9CR26 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Vta1Q9CR26 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Vta1Q9CR26 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Vta1Q9CR26 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Vta1Q9CR26 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Vta1Q9CR26 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Vta1Q9CR26 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Vta1Q9CR26 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Vta1Q9CR26 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Vta1Q9CR26 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Vta1Q9CR26 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Vta1Q9CR26 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Vta1Q9CR26 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Vta1Q9CR26 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Vta1Q9CR26 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Vta1Q9CR26 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Vta1Q9CR26 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Vta1Q9CR26 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Vta1Q9CR26 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Vta1Q9CR26 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms