Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ39

Med21, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 21, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med21Q9CQ39 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Med21Q9CQ39 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Med21Q9CQ39 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Med21Q9CQ39 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Med21Q9CQ39 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Med21Q9CQ39 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Med21Q9CQ39 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Med21Q9CQ39 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Med21Q9CQ39 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Med21Q9CQ39 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Med21Q9CQ39 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Med21Q9CQ39 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Med21Q9CQ39 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Med21Q9CQ39 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Med21Q9CQ39 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Med21Q9CQ39 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Med21Q9CQ39 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Med21Q9CQ39 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Med21Q9CQ39 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Med21Q9CQ39 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Med21Q9CQ39 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Med21Q9CQ39 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Med21Q9CQ39 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Med21Q9CQ39 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Med21Q9CQ39 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Med21Q9CQ39 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Med21Q9CQ39 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Med21Q9CQ39 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Med21Q9CQ39 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Med21Q9CQ39 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Med21Q9CQ39 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Med21Q9CQ39 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Med21Q9CQ39 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Med21Q9CQ39 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Med21Q9CQ39 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Med21Q9CQ39 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Med21Q9CQ39 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Med21Q9CQ39 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Med21Q9CQ39 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Med21Q9CQ39 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Med21Q9CQ39 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Med21Q9CQ39 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Med21Q9CQ39 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Med21Q9CQ39 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Med21Q9CQ39 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Med21Q9CQ39 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Med21Q9CQ39 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Med21Q9CQ39 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Med21Q9CQ39 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Med21Q9CQ39 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Med21Q9CQ39 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Med21Q9CQ39 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Med21Q9CQ39 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Med21Q9CQ39 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Med21Q9CQ39 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Med21Q9CQ39 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Med21Q9CQ39 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Med21Q9CQ39 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Med21Q9CQ39 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Med21Q9CQ39 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Med21Q9CQ39 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Med21Q9CQ39 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Med21Q9CQ39 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Med21Q9CQ39 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Med21Q9CQ39 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Med21Q9CQ39 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Med21Q9CQ39 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Med21Q9CQ39 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Med21Q9CQ39 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Med21Q9CQ39 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Med21Q9CQ39 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Med21Q9CQ39 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Med21Q9CQ39 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Med21Q9CQ39 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Med21Q9CQ39 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Med21Q9CQ39 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Med21Q9CQ39 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Med21Q9CQ39 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Med21Q9CQ39 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Med21Q9CQ39 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Med21Q9CQ39 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Med21Q9CQ39 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Med21Q9CQ39 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Med21Q9CQ39 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Med21Q9CQ39 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Med21Q9CQ39 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Med21Q9CQ39 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Med21Q9CQ39 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Med21Q9CQ39 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Med21Q9CQ39 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Med21Q9CQ39 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Med21Q9CQ39 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Med21Q9CQ39 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Med21Q9CQ39 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Med21Q9CQ39 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Med21Q9CQ39 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Med21Q9CQ39 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Med21Q9CQ39 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Med21Q9CQ39 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Med21Q9CQ39 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms