Protein–RNA interactions for Protein: Q99PI4

Lpin3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lpin3Q99PI4 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lpin3Q99PI4 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lpin3Q99PI4 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lpin3Q99PI4 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lpin3Q99PI4 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lpin3Q99PI4 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lpin3Q99PI4 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Lpin3Q99PI4 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Lpin3Q99PI4 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Lpin3Q99PI4 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lpin3Q99PI4 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Lpin3Q99PI4 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lpin3Q99PI4 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lpin3Q99PI4 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lpin3Q99PI4 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lpin3Q99PI4 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lpin3Q99PI4 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lpin3Q99PI4 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lpin3Q99PI4 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lpin3Q99PI4 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lpin3Q99PI4 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lpin3Q99PI4 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lpin3Q99PI4 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lpin3Q99PI4 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lpin3Q99PI4 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Lpin3Q99PI4 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lpin3Q99PI4 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lpin3Q99PI4 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lpin3Q99PI4 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lpin3Q99PI4 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lpin3Q99PI4 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lpin3Q99PI4 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lpin3Q99PI4 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Lpin3Q99PI4 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lpin3Q99PI4 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lpin3Q99PI4 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lpin3Q99PI4 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lpin3Q99PI4 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lpin3Q99PI4 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lpin3Q99PI4 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Lpin3Q99PI4 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lpin3Q99PI4 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lpin3Q99PI4 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lpin3Q99PI4 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lpin3Q99PI4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lpin3Q99PI4 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lpin3Q99PI4 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lpin3Q99PI4 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Lpin3Q99PI4 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lpin3Q99PI4 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lpin3Q99PI4 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lpin3Q99PI4 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lpin3Q99PI4 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lpin3Q99PI4 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lpin3Q99PI4 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Lpin3Q99PI4 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lpin3Q99PI4 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lpin3Q99PI4 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Lpin3Q99PI4 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lpin3Q99PI4 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Lpin3Q99PI4 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lpin3Q99PI4 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lpin3Q99PI4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lpin3Q99PI4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lpin3Q99PI4 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lpin3Q99PI4 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lpin3Q99PI4 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Lpin3Q99PI4 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Lpin3Q99PI4 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lpin3Q99PI4 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lpin3Q99PI4 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lpin3Q99PI4 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lpin3Q99PI4 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lpin3Q99PI4 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lpin3Q99PI4 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lpin3Q99PI4 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lpin3Q99PI4 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lpin3Q99PI4 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lpin3Q99PI4 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lpin3Q99PI4 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lpin3Q99PI4 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lpin3Q99PI4 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lpin3Q99PI4 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Lpin3Q99PI4 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lpin3Q99PI4 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Lpin3Q99PI4 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Lpin3Q99PI4 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Lpin3Q99PI4 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lpin3Q99PI4 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lpin3Q99PI4 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lpin3Q99PI4 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lpin3Q99PI4 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lpin3Q99PI4 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lpin3Q99PI4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lpin3Q99PI4 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lpin3Q99PI4 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lpin3Q99PI4 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lpin3Q99PI4 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lpin3Q99PI4 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lpin3Q99PI4 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms