Protein–RNA interactions for Protein: Q99P88

Nup155, Nuclear pore complex protein Nup155, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup155Q99P88 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Nup155Q99P88 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Nup155Q99P88 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
Nup155Q99P88 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
Nup155Q99P88 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Nup155Q99P88 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
Nup155Q99P88 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
Nup155Q99P88 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
Nup155Q99P88 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
Nup155Q99P88 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
Nup155Q99P88 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Nup155Q99P88 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Nup155Q99P88 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Nup155Q99P88 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Nup155Q99P88 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Nup155Q99P88 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Nup155Q99P88 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Nup155Q99P88 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
Nup155Q99P88 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Nup155Q99P88 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
Nup155Q99P88 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Nup155Q99P88 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Nup155Q99P88 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Nup155Q99P88 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Nup155Q99P88 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Nup155Q99P88 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Nup155Q99P88 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Nup155Q99P88 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Nup155Q99P88 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Nup155Q99P88 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Nup155Q99P88 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
Nup155Q99P88 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Nup155Q99P88 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Nup155Q99P88 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Nup155Q99P88 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
Nup155Q99P88 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Nup155Q99P88 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
Nup155Q99P88 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Nup155Q99P88 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
Nup155Q99P88 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
Nup155Q99P88 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Nup155Q99P88 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
Nup155Q99P88 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Nup155Q99P88 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
Nup155Q99P88 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
Nup155Q99P88 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Nup155Q99P88 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
Nup155Q99P88 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
Nup155Q99P88 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
Nup155Q99P88 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Nup155Q99P88 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Nup155Q99P88 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Nup155Q99P88 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Nup155Q99P88 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Nup155Q99P88 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC34.09■■■■□ 3.05
Nup155Q99P88 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC34.07■■■■□ 3.05
Nup155Q99P88 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC34.07■■■■□ 3.05
Nup155Q99P88 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
Nup155Q99P88 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Nup155Q99P88 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Nup155Q99P88 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Nup155Q99P88 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Nup155Q99P88 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Nup155Q99P88 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
Nup155Q99P88 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Nup155Q99P88 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Nup155Q99P88 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Nup155Q99P88 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Nup155Q99P88 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
Nup155Q99P88 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Nup155Q99P88 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
Nup155Q99P88 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC34.01■■■■□ 3.04
Nup155Q99P88 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
Nup155Q99P88 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
Nup155Q99P88 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Nup155Q99P88 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Nup155Q99P88 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Nup155Q99P88 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
Nup155Q99P88 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Nup155Q99P88 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
Nup155Q99P88 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Nup155Q99P88 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Nup155Q99P88 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
Nup155Q99P88 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Nup155Q99P88 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
Nup155Q99P88 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Nup155Q99P88 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
Nup155Q99P88 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
Nup155Q99P88 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Nup155Q99P88 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Nup155Q99P88 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.02
Nup155Q99P88 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
Nup155Q99P88 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Nup155Q99P88 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Nup155Q99P88 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Nup155Q99P88 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Nup155Q99P88 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Nup155Q99P88 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
Nup155Q99P88 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Nup155Q99P88 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms