Protein–RNA interactions for Protein: Q99NE5

Rims1, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims1Q99NE5 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
Rims1Q99NE5 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Rims1Q99NE5 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Rims1Q99NE5 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Rims1Q99NE5 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Rims1Q99NE5 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Rims1Q99NE5 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
Rims1Q99NE5 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Rims1Q99NE5 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Rims1Q99NE5 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Rims1Q99NE5 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Rims1Q99NE5 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Rims1Q99NE5 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Rims1Q99NE5 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC33.03■■■□□ 2.88
Rims1Q99NE5 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
Rims1Q99NE5 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Rims1Q99NE5 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Rims1Q99NE5 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Rims1Q99NE5 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Rims1Q99NE5 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Rims1Q99NE5 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Rims1Q99NE5 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
Rims1Q99NE5 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.88
Rims1Q99NE5 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
Rims1Q99NE5 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Rims1Q99NE5 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
Rims1Q99NE5 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
Rims1Q99NE5 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Rims1Q99NE5 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Rims1Q99NE5 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
Rims1Q99NE5 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Rims1Q99NE5 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
Rims1Q99NE5 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
Rims1Q99NE5 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Rims1Q99NE5 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Rims1Q99NE5 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
Rims1Q99NE5 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC32.97■■■□□ 2.87
Rims1Q99NE5 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Rims1Q99NE5 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Rims1Q99NE5 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Rims1Q99NE5 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
Rims1Q99NE5 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Rims1Q99NE5 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
Rims1Q99NE5 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Rims1Q99NE5 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Rims1Q99NE5 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Rims1Q99NE5 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Rims1Q99NE5 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC32.91■■■□□ 2.86
Rims1Q99NE5 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Rims1Q99NE5 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Rims1Q99NE5 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Rims1Q99NE5 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
Rims1Q99NE5 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Rims1Q99NE5 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Rims1Q99NE5 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Rims1Q99NE5 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Rims1Q99NE5 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Rims1Q99NE5 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Rims1Q99NE5 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Rims1Q99NE5 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
Rims1Q99NE5 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC32.86■■■□□ 2.85
Rims1Q99NE5 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Rims1Q99NE5 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Rims1Q99NE5 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
Rims1Q99NE5 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Rims1Q99NE5 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Rims1Q99NE5 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Rims1Q99NE5 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
Rims1Q99NE5 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Rims1Q99NE5 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Rims1Q99NE5 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Rims1Q99NE5 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Rims1Q99NE5 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Rims1Q99NE5 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
Rims1Q99NE5 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
Rims1Q99NE5 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Rims1Q99NE5 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Rims1Q99NE5 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Rims1Q99NE5 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Rims1Q99NE5 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
Rims1Q99NE5 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Rims1Q99NE5 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
Rims1Q99NE5 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Rims1Q99NE5 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Rims1Q99NE5 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Rims1Q99NE5 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
Rims1Q99NE5 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Rims1Q99NE5 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Rims1Q99NE5 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
Rims1Q99NE5 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC32.76■■■□□ 2.84
Rims1Q99NE5 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
Rims1Q99NE5 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
Rims1Q99NE5 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
Rims1Q99NE5 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Rims1Q99NE5 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
Rims1Q99NE5 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Rims1Q99NE5 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
Rims1Q99NE5 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
Rims1Q99NE5 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
Rims1Q99NE5 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms