Protein–RNA interactions for Protein: Q99NA9

Pcgf6, Polycomb group RING finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcgf6Q99NA9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
Pcgf6Q99NA9 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Pcgf6Q99NA9 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
Pcgf6Q99NA9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Pcgf6Q99NA9 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC33.66■■■□□ 2.98
Pcgf6Q99NA9 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Pcgf6Q99NA9 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Pcgf6Q99NA9 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Pcgf6Q99NA9 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Pcgf6Q99NA9 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
Pcgf6Q99NA9 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Pcgf6Q99NA9 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Pcgf6Q99NA9 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Pcgf6Q99NA9 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Pcgf6Q99NA9 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Pcgf6Q99NA9 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Pcgf6Q99NA9 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Pcgf6Q99NA9 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Pcgf6Q99NA9 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Pcgf6Q99NA9 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Pcgf6Q99NA9 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
Pcgf6Q99NA9 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Pcgf6Q99NA9 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Pcgf6Q99NA9 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
Pcgf6Q99NA9 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Pcgf6Q99NA9 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Pcgf6Q99NA9 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
Pcgf6Q99NA9 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Pcgf6Q99NA9 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Pcgf6Q99NA9 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.57■■■□□ 2.96
Pcgf6Q99NA9 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
Pcgf6Q99NA9 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Pcgf6Q99NA9 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC33.55■■■□□ 2.96
Pcgf6Q99NA9 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Pcgf6Q99NA9 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Pcgf6Q99NA9 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Pcgf6Q99NA9 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Pcgf6Q99NA9 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Pcgf6Q99NA9 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
Pcgf6Q99NA9 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Pcgf6Q99NA9 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Pcgf6Q99NA9 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Pcgf6Q99NA9 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Pcgf6Q99NA9 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Pcgf6Q99NA9 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Pcgf6Q99NA9 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Pcgf6Q99NA9 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Pcgf6Q99NA9 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
Pcgf6Q99NA9 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Pcgf6Q99NA9 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Pcgf6Q99NA9 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
Pcgf6Q99NA9 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Pcgf6Q99NA9 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Pcgf6Q99NA9 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Pcgf6Q99NA9 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Pcgf6Q99NA9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Pcgf6Q99NA9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Pcgf6Q99NA9 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
Pcgf6Q99NA9 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC33.45■■■□□ 2.95
Pcgf6Q99NA9 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Pcgf6Q99NA9 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
Pcgf6Q99NA9 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
Pcgf6Q99NA9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Pcgf6Q99NA9 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Pcgf6Q99NA9 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Pcgf6Q99NA9 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Pcgf6Q99NA9 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Pcgf6Q99NA9 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
Pcgf6Q99NA9 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
Pcgf6Q99NA9 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Pcgf6Q99NA9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Pcgf6Q99NA9 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Pcgf6Q99NA9 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
Pcgf6Q99NA9 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Pcgf6Q99NA9 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
Pcgf6Q99NA9 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Pcgf6Q99NA9 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Pcgf6Q99NA9 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Pcgf6Q99NA9 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
Pcgf6Q99NA9 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Pcgf6Q99NA9 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Pcgf6Q99NA9 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC33.38■■■□□ 2.93
Pcgf6Q99NA9 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Pcgf6Q99NA9 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Pcgf6Q99NA9 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Pcgf6Q99NA9 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Pcgf6Q99NA9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Pcgf6Q99NA9 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Pcgf6Q99NA9 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Pcgf6Q99NA9 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Pcgf6Q99NA9 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Pcgf6Q99NA9 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Pcgf6Q99NA9 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Pcgf6Q99NA9 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.93
Pcgf6Q99NA9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Pcgf6Q99NA9 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
Pcgf6Q99NA9 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Pcgf6Q99NA9 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Pcgf6Q99NA9 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Pcgf6Q99NA9 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms