Protein–RNA interactions for Protein: Q99L02

Pagr1a, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1aQ99L02 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Pagr1aQ99L02 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Pagr1aQ99L02 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Pagr1aQ99L02 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Pagr1aQ99L02 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Pagr1aQ99L02 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Pagr1aQ99L02 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Pagr1aQ99L02 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Pagr1aQ99L02 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Pagr1aQ99L02 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Pagr1aQ99L02 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Pagr1aQ99L02 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Pagr1aQ99L02 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Pagr1aQ99L02 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Pagr1aQ99L02 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Pagr1aQ99L02 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Pagr1aQ99L02 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Pagr1aQ99L02 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Pagr1aQ99L02 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Pagr1aQ99L02 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Pagr1aQ99L02 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Pagr1aQ99L02 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Pagr1aQ99L02 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Pagr1aQ99L02 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Pagr1aQ99L02 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Pagr1aQ99L02 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Pagr1aQ99L02 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Pagr1aQ99L02 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Pagr1aQ99L02 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Pagr1aQ99L02 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Pagr1aQ99L02 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Pagr1aQ99L02 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Pagr1aQ99L02 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Pagr1aQ99L02 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Pagr1aQ99L02 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Pagr1aQ99L02 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Pagr1aQ99L02 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Pagr1aQ99L02 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Pagr1aQ99L02 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Pagr1aQ99L02 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Pagr1aQ99L02 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Pagr1aQ99L02 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Pagr1aQ99L02 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Pagr1aQ99L02 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Pagr1aQ99L02 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Pagr1aQ99L02 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Pagr1aQ99L02 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Pagr1aQ99L02 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Pagr1aQ99L02 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Pagr1aQ99L02 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Pagr1aQ99L02 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Pagr1aQ99L02 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Pagr1aQ99L02 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Pagr1aQ99L02 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Pagr1aQ99L02 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Pagr1aQ99L02 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Pagr1aQ99L02 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Pagr1aQ99L02 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Pagr1aQ99L02 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Pagr1aQ99L02 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Pagr1aQ99L02 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Pagr1aQ99L02 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Pagr1aQ99L02 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Pagr1aQ99L02 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Pagr1aQ99L02 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Pagr1aQ99L02 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Pagr1aQ99L02 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Pagr1aQ99L02 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Pagr1aQ99L02 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Pagr1aQ99L02 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Pagr1aQ99L02 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Pagr1aQ99L02 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Pagr1aQ99L02 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Pagr1aQ99L02 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Pagr1aQ99L02 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Pagr1aQ99L02 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Pagr1aQ99L02 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Pagr1aQ99L02 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Pagr1aQ99L02 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Pagr1aQ99L02 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Pagr1aQ99L02 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Pagr1aQ99L02 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Pagr1aQ99L02 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Pagr1aQ99L02 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Pagr1aQ99L02 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Pagr1aQ99L02 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Pagr1aQ99L02 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Pagr1aQ99L02 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Pagr1aQ99L02 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Pagr1aQ99L02 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Pagr1aQ99L02 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Pagr1aQ99L02 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Pagr1aQ99L02 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Pagr1aQ99L02 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
Pagr1aQ99L02 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Pagr1aQ99L02 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Pagr1aQ99L02 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Pagr1aQ99L02 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Pagr1aQ99L02 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Pagr1aQ99L02 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms