Protein–RNA interactions for Protein: Q99JR1

Sfxn1, Sideroflexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfxn1Q99JR1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sfxn1Q99JR1 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sfxn1Q99JR1 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sfxn1Q99JR1 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Sfxn1Q99JR1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sfxn1Q99JR1 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Sfxn1Q99JR1 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sfxn1Q99JR1 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sfxn1Q99JR1 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sfxn1Q99JR1 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sfxn1Q99JR1 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sfxn1Q99JR1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sfxn1Q99JR1 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sfxn1Q99JR1 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sfxn1Q99JR1 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sfxn1Q99JR1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sfxn1Q99JR1 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sfxn1Q99JR1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sfxn1Q99JR1 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sfxn1Q99JR1 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sfxn1Q99JR1 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sfxn1Q99JR1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sfxn1Q99JR1 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sfxn1Q99JR1 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sfxn1Q99JR1 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sfxn1Q99JR1 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sfxn1Q99JR1 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sfxn1Q99JR1 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sfxn1Q99JR1 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sfxn1Q99JR1 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sfxn1Q99JR1 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Sfxn1Q99JR1 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sfxn1Q99JR1 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sfxn1Q99JR1 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sfxn1Q99JR1 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Sfxn1Q99JR1 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sfxn1Q99JR1 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sfxn1Q99JR1 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Sfxn1Q99JR1 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sfxn1Q99JR1 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Sfxn1Q99JR1 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sfxn1Q99JR1 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sfxn1Q99JR1 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Sfxn1Q99JR1 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Sfxn1Q99JR1 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
Sfxn1Q99JR1 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sfxn1Q99JR1 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sfxn1Q99JR1 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sfxn1Q99JR1 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sfxn1Q99JR1 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sfxn1Q99JR1 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sfxn1Q99JR1 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sfxn1Q99JR1 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sfxn1Q99JR1 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sfxn1Q99JR1 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sfxn1Q99JR1 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sfxn1Q99JR1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Sfxn1Q99JR1 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sfxn1Q99JR1 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Sfxn1Q99JR1 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sfxn1Q99JR1 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sfxn1Q99JR1 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sfxn1Q99JR1 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sfxn1Q99JR1 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sfxn1Q99JR1 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sfxn1Q99JR1 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sfxn1Q99JR1 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sfxn1Q99JR1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sfxn1Q99JR1 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sfxn1Q99JR1 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sfxn1Q99JR1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sfxn1Q99JR1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sfxn1Q99JR1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sfxn1Q99JR1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sfxn1Q99JR1 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sfxn1Q99JR1 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sfxn1Q99JR1 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sfxn1Q99JR1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sfxn1Q99JR1 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sfxn1Q99JR1 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sfxn1Q99JR1 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sfxn1Q99JR1 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sfxn1Q99JR1 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Sfxn1Q99JR1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sfxn1Q99JR1 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sfxn1Q99JR1 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sfxn1Q99JR1 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Sfxn1Q99JR1 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sfxn1Q99JR1 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Sfxn1Q99JR1 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sfxn1Q99JR1 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sfxn1Q99JR1 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sfxn1Q99JR1 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Sfxn1Q99JR1 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sfxn1Q99JR1 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sfxn1Q99JR1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sfxn1Q99JR1 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sfxn1Q99JR1 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sfxn1Q99JR1 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Sfxn1Q99JR1 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms