Protein–RNA interactions for Protein: Q921M3

Sf3b3, Splicing factor 3B subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b3Q921M3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Sf3b3Q921M3 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Sf3b3Q921M3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Sf3b3Q921M3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Sf3b3Q921M3 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Sf3b3Q921M3 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Sf3b3Q921M3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Sf3b3Q921M3 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Sf3b3Q921M3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Sf3b3Q921M3 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Sf3b3Q921M3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Sf3b3Q921M3 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Sf3b3Q921M3 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Sf3b3Q921M3 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Sf3b3Q921M3 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Sf3b3Q921M3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Sf3b3Q921M3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Sf3b3Q921M3 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Sf3b3Q921M3 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Sf3b3Q921M3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Sf3b3Q921M3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Sf3b3Q921M3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Sf3b3Q921M3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Sf3b3Q921M3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Sf3b3Q921M3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Sf3b3Q921M3 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Sf3b3Q921M3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Sf3b3Q921M3 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Sf3b3Q921M3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Sf3b3Q921M3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Sf3b3Q921M3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Sf3b3Q921M3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Sf3b3Q921M3 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Sf3b3Q921M3 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Sf3b3Q921M3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Sf3b3Q921M3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Sf3b3Q921M3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Sf3b3Q921M3 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Sf3b3Q921M3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Sf3b3Q921M3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Sf3b3Q921M3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Sf3b3Q921M3 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Sf3b3Q921M3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Sf3b3Q921M3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Sf3b3Q921M3 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Sf3b3Q921M3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Sf3b3Q921M3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Sf3b3Q921M3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Sf3b3Q921M3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Sf3b3Q921M3 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
Sf3b3Q921M3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Sf3b3Q921M3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Sf3b3Q921M3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Sf3b3Q921M3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Sf3b3Q921M3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Sf3b3Q921M3 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Sf3b3Q921M3 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Sf3b3Q921M3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Sf3b3Q921M3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Sf3b3Q921M3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Sf3b3Q921M3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Sf3b3Q921M3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Sf3b3Q921M3 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Sf3b3Q921M3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Sf3b3Q921M3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Sf3b3Q921M3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Sf3b3Q921M3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Sf3b3Q921M3 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Sf3b3Q921M3 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Sf3b3Q921M3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Sf3b3Q921M3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Sf3b3Q921M3 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Sf3b3Q921M3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Sf3b3Q921M3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Sf3b3Q921M3 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Sf3b3Q921M3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Sf3b3Q921M3 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Sf3b3Q921M3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Sf3b3Q921M3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Sf3b3Q921M3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Sf3b3Q921M3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Sf3b3Q921M3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Sf3b3Q921M3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Sf3b3Q921M3 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Sf3b3Q921M3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Sf3b3Q921M3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Sf3b3Q921M3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Sf3b3Q921M3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Sf3b3Q921M3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Sf3b3Q921M3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Sf3b3Q921M3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Sf3b3Q921M3 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Sf3b3Q921M3 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Sf3b3Q921M3 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Sf3b3Q921M3 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Sf3b3Q921M3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Sf3b3Q921M3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Sf3b3Q921M3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Sf3b3Q921M3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Sf3b3Q921M3 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms