Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZR4

Nek8, Serine/threonine-protein kinase Nek8, mousemouse

Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek8Q91ZR4 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nek8Q91ZR4 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nek8Q91ZR4 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nek8Q91ZR4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Nek8Q91ZR4 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nek8Q91ZR4 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nek8Q91ZR4 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nek8Q91ZR4 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nek8Q91ZR4 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nek8Q91ZR4 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nek8Q91ZR4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nek8Q91ZR4 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nek8Q91ZR4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nek8Q91ZR4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nek8Q91ZR4 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nek8Q91ZR4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nek8Q91ZR4 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nek8Q91ZR4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nek8Q91ZR4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nek8Q91ZR4 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nek8Q91ZR4 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nek8Q91ZR4 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nek8Q91ZR4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nek8Q91ZR4 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nek8Q91ZR4 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nek8Q91ZR4 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nek8Q91ZR4 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nek8Q91ZR4 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nek8Q91ZR4 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nek8Q91ZR4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nek8Q91ZR4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nek8Q91ZR4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nek8Q91ZR4 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nek8Q91ZR4 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nek8Q91ZR4 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nek8Q91ZR4 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nek8Q91ZR4 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nek8Q91ZR4 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nek8Q91ZR4 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nek8Q91ZR4 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nek8Q91ZR4 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nek8Q91ZR4 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nek8Q91ZR4 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nek8Q91ZR4 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nek8Q91ZR4 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nek8Q91ZR4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nek8Q91ZR4 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nek8Q91ZR4 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nek8Q91ZR4 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nek8Q91ZR4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nek8Q91ZR4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nek8Q91ZR4 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nek8Q91ZR4 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nek8Q91ZR4 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nek8Q91ZR4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nek8Q91ZR4 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Nek8Q91ZR4 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nek8Q91ZR4 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nek8Q91ZR4 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nek8Q91ZR4 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nek8Q91ZR4 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Nek8Q91ZR4 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Nek8Q91ZR4 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nek8Q91ZR4 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nek8Q91ZR4 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nek8Q91ZR4 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nek8Q91ZR4 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nek8Q91ZR4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nek8Q91ZR4 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nek8Q91ZR4 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nek8Q91ZR4 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nek8Q91ZR4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nek8Q91ZR4 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nek8Q91ZR4 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nek8Q91ZR4 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nek8Q91ZR4 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nek8Q91ZR4 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Nek8Q91ZR4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nek8Q91ZR4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nek8Q91ZR4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nek8Q91ZR4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nek8Q91ZR4 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nek8Q91ZR4 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nek8Q91ZR4 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nek8Q91ZR4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nek8Q91ZR4 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nek8Q91ZR4 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nek8Q91ZR4 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nek8Q91ZR4 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nek8Q91ZR4 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nek8Q91ZR4 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nek8Q91ZR4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nek8Q91ZR4 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nek8Q91ZR4 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nek8Q91ZR4 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nek8Q91ZR4 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nek8Q91ZR4 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nek8Q91ZR4 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nek8Q91ZR4 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nek8Q91ZR4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms