Protein–RNA interactions for Protein: Q8VIM4

Bsnd, Barttin, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BsndQ8VIM4 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BsndQ8VIM4 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BsndQ8VIM4 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BsndQ8VIM4 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BsndQ8VIM4 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BsndQ8VIM4 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BsndQ8VIM4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BsndQ8VIM4 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BsndQ8VIM4 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BsndQ8VIM4 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BsndQ8VIM4 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BsndQ8VIM4 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BsndQ8VIM4 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BsndQ8VIM4 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BsndQ8VIM4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BsndQ8VIM4 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BsndQ8VIM4 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BsndQ8VIM4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BsndQ8VIM4 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BsndQ8VIM4 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BsndQ8VIM4 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BsndQ8VIM4 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BsndQ8VIM4 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BsndQ8VIM4 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BsndQ8VIM4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BsndQ8VIM4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BsndQ8VIM4 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BsndQ8VIM4 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BsndQ8VIM4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BsndQ8VIM4 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BsndQ8VIM4 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BsndQ8VIM4 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BsndQ8VIM4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BsndQ8VIM4 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BsndQ8VIM4 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BsndQ8VIM4 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BsndQ8VIM4 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BsndQ8VIM4 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BsndQ8VIM4 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BsndQ8VIM4 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BsndQ8VIM4 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BsndQ8VIM4 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BsndQ8VIM4 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BsndQ8VIM4 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BsndQ8VIM4 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BsndQ8VIM4 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BsndQ8VIM4 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BsndQ8VIM4 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BsndQ8VIM4 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BsndQ8VIM4 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
BsndQ8VIM4 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BsndQ8VIM4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BsndQ8VIM4 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BsndQ8VIM4 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BsndQ8VIM4 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
BsndQ8VIM4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
BsndQ8VIM4 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
BsndQ8VIM4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BsndQ8VIM4 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BsndQ8VIM4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BsndQ8VIM4 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BsndQ8VIM4 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BsndQ8VIM4 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BsndQ8VIM4 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BsndQ8VIM4 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BsndQ8VIM4 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BsndQ8VIM4 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BsndQ8VIM4 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BsndQ8VIM4 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BsndQ8VIM4 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BsndQ8VIM4 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BsndQ8VIM4 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BsndQ8VIM4 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BsndQ8VIM4 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BsndQ8VIM4 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BsndQ8VIM4 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
BsndQ8VIM4 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BsndQ8VIM4 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BsndQ8VIM4 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BsndQ8VIM4 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BsndQ8VIM4 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BsndQ8VIM4 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BsndQ8VIM4 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BsndQ8VIM4 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BsndQ8VIM4 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BsndQ8VIM4 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BsndQ8VIM4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BsndQ8VIM4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BsndQ8VIM4 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BsndQ8VIM4 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BsndQ8VIM4 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BsndQ8VIM4 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BsndQ8VIM4 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BsndQ8VIM4 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
BsndQ8VIM4 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BsndQ8VIM4 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BsndQ8VIM4 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BsndQ8VIM4 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BsndQ8VIM4 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BsndQ8VIM4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms