Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDC1

Fyco1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fyco1Q8VDC1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.02■■■■□ 3.52
Fyco1Q8VDC1 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC37.02■■■■□ 3.52
Fyco1Q8VDC1 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC37.02■■■■□ 3.52
Fyco1Q8VDC1 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC37.02■■■■□ 3.52
Fyco1Q8VDC1 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
Fyco1Q8VDC1 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37■■■■□ 3.51
Fyco1Q8VDC1 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC37■■■■□ 3.51
Fyco1Q8VDC1 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
Fyco1Q8VDC1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
Fyco1Q8VDC1 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
Fyco1Q8VDC1 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
Fyco1Q8VDC1 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
Fyco1Q8VDC1 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC36.96■■■■□ 3.51
Fyco1Q8VDC1 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
Fyco1Q8VDC1 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
Fyco1Q8VDC1 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
Fyco1Q8VDC1 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
Fyco1Q8VDC1 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC36.95■■■■□ 3.51
Fyco1Q8VDC1 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC36.95■■■■□ 3.51
Fyco1Q8VDC1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.5
Fyco1Q8VDC1 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
Fyco1Q8VDC1 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
Fyco1Q8VDC1 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
Fyco1Q8VDC1 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
Fyco1Q8VDC1 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
Fyco1Q8VDC1 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC36.93■■■■□ 3.5
Fyco1Q8VDC1 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
Fyco1Q8VDC1 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC36.92■■■■□ 3.5
Fyco1Q8VDC1 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
Fyco1Q8VDC1 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC36.91■■■■□ 3.5
Fyco1Q8VDC1 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
Fyco1Q8VDC1 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
Fyco1Q8VDC1 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC36.89■■■■□ 3.5
Fyco1Q8VDC1 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC36.89■■■■□ 3.5
Fyco1Q8VDC1 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
Fyco1Q8VDC1 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC36.88■■■■□ 3.49
Fyco1Q8VDC1 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
Fyco1Q8VDC1 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
Fyco1Q8VDC1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC36.87■■■■□ 3.49
Fyco1Q8VDC1 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
Fyco1Q8VDC1 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
Fyco1Q8VDC1 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
Fyco1Q8VDC1 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
Fyco1Q8VDC1 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC36.86■■■■□ 3.49
Fyco1Q8VDC1 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
Fyco1Q8VDC1 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
Fyco1Q8VDC1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
Fyco1Q8VDC1 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
Fyco1Q8VDC1 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
Fyco1Q8VDC1 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC36.83■■■■□ 3.49
Fyco1Q8VDC1 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
Fyco1Q8VDC1 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC36.83■■■■□ 3.49
Fyco1Q8VDC1 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.83■■■■□ 3.49
Fyco1Q8VDC1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
Fyco1Q8VDC1 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
Fyco1Q8VDC1 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC36.8■■■■□ 3.48
Fyco1Q8VDC1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
Fyco1Q8VDC1 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
Fyco1Q8VDC1 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
Fyco1Q8VDC1 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC36.79■■■■□ 3.48
Fyco1Q8VDC1 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
Fyco1Q8VDC1 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC36.78■■■■□ 3.48
Fyco1Q8VDC1 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC36.78■■■■□ 3.48
Fyco1Q8VDC1 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.76■■■■□ 3.47
Fyco1Q8VDC1 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC36.76■■■■□ 3.47
Fyco1Q8VDC1 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
Fyco1Q8VDC1 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.76■■■■□ 3.47
Fyco1Q8VDC1 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
Fyco1Q8VDC1 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC36.75■■■■□ 3.47
Fyco1Q8VDC1 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC36.74■■■■□ 3.47
Fyco1Q8VDC1 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
Fyco1Q8VDC1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.73■■■■□ 3.47
Fyco1Q8VDC1 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
Fyco1Q8VDC1 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
Fyco1Q8VDC1 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
Fyco1Q8VDC1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
Fyco1Q8VDC1 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
Fyco1Q8VDC1 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
Fyco1Q8VDC1 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
Fyco1Q8VDC1 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Fyco1Q8VDC1 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC36.67■■■■□ 3.46
Fyco1Q8VDC1 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC36.67■■■■□ 3.46
Fyco1Q8VDC1 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Fyco1Q8VDC1 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC36.67■■■■□ 3.46
Fyco1Q8VDC1 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
Fyco1Q8VDC1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
Fyco1Q8VDC1 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
Fyco1Q8VDC1 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
Fyco1Q8VDC1 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
Fyco1Q8VDC1 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
Fyco1Q8VDC1 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC36.63■■■■□ 3.45
Fyco1Q8VDC1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
Fyco1Q8VDC1 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Fyco1Q8VDC1 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Fyco1Q8VDC1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Fyco1Q8VDC1 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
Fyco1Q8VDC1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Fyco1Q8VDC1 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC36.58■■■■□ 3.45
Fyco1Q8VDC1 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
Fyco1Q8VDC1 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms