Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2X8

Gtf2h5, General transcription factor IIH subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 71 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2h5Q8K2X8 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gtf2h5Q8K2X8 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gtf2h5Q8K2X8 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gtf2h5Q8K2X8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gtf2h5Q8K2X8 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gtf2h5Q8K2X8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Gtf2h5Q8K2X8 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gtf2h5Q8K2X8 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gtf2h5Q8K2X8 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gtf2h5Q8K2X8 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gtf2h5Q8K2X8 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gtf2h5Q8K2X8 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gtf2h5Q8K2X8 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gtf2h5Q8K2X8 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gtf2h5Q8K2X8 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gtf2h5Q8K2X8 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gtf2h5Q8K2X8 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gtf2h5Q8K2X8 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gtf2h5Q8K2X8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gtf2h5Q8K2X8 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gtf2h5Q8K2X8 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gtf2h5Q8K2X8 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gtf2h5Q8K2X8 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gtf2h5Q8K2X8 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gtf2h5Q8K2X8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gtf2h5Q8K2X8 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gtf2h5Q8K2X8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gtf2h5Q8K2X8 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gtf2h5Q8K2X8 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gtf2h5Q8K2X8 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gtf2h5Q8K2X8 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gtf2h5Q8K2X8 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtf2h5Q8K2X8 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtf2h5Q8K2X8 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtf2h5Q8K2X8 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtf2h5Q8K2X8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtf2h5Q8K2X8 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtf2h5Q8K2X8 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtf2h5Q8K2X8 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtf2h5Q8K2X8 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtf2h5Q8K2X8 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtf2h5Q8K2X8 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtf2h5Q8K2X8 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtf2h5Q8K2X8 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtf2h5Q8K2X8 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtf2h5Q8K2X8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtf2h5Q8K2X8 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtf2h5Q8K2X8 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtf2h5Q8K2X8 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gtf2h5Q8K2X8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gtf2h5Q8K2X8 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gtf2h5Q8K2X8 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gtf2h5Q8K2X8 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gtf2h5Q8K2X8 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gtf2h5Q8K2X8 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gtf2h5Q8K2X8 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gtf2h5Q8K2X8 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gtf2h5Q8K2X8 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Gtf2h5Q8K2X8 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gtf2h5Q8K2X8 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Gtf2h5Q8K2X8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gtf2h5Q8K2X8 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Gtf2h5Q8K2X8 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtf2h5Q8K2X8 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtf2h5Q8K2X8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtf2h5Q8K2X8 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtf2h5Q8K2X8 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gtf2h5Q8K2X8 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gtf2h5Q8K2X8 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gtf2h5Q8K2X8 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gtf2h5Q8K2X8 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gtf2h5Q8K2X8 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gtf2h5Q8K2X8 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Gtf2h5Q8K2X8 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gtf2h5Q8K2X8 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gtf2h5Q8K2X8 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gtf2h5Q8K2X8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gtf2h5Q8K2X8 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gtf2h5Q8K2X8 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gtf2h5Q8K2X8 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gtf2h5Q8K2X8 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gtf2h5Q8K2X8 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gtf2h5Q8K2X8 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gtf2h5Q8K2X8 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gtf2h5Q8K2X8 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gtf2h5Q8K2X8 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gtf2h5Q8K2X8 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gtf2h5Q8K2X8 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtf2h5Q8K2X8 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtf2h5Q8K2X8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtf2h5Q8K2X8 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtf2h5Q8K2X8 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtf2h5Q8K2X8 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtf2h5Q8K2X8 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtf2h5Q8K2X8 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtf2h5Q8K2X8 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtf2h5Q8K2X8 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtf2h5Q8K2X8 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtf2h5Q8K2X8 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtf2h5Q8K2X8 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 118.3 ms