Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE13

Ccdc17, Coiled-coil domain-containing protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc17Q8CE13 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc17Q8CE13 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc17Q8CE13 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc17Q8CE13 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc17Q8CE13 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc17Q8CE13 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc17Q8CE13 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc17Q8CE13 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc17Q8CE13 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc17Q8CE13 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc17Q8CE13 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc17Q8CE13 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc17Q8CE13 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc17Q8CE13 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc17Q8CE13 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc17Q8CE13 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc17Q8CE13 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc17Q8CE13 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc17Q8CE13 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc17Q8CE13 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc17Q8CE13 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc17Q8CE13 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc17Q8CE13 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc17Q8CE13 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc17Q8CE13 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc17Q8CE13 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc17Q8CE13 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc17Q8CE13 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc17Q8CE13 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc17Q8CE13 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc17Q8CE13 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc17Q8CE13 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc17Q8CE13 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc17Q8CE13 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc17Q8CE13 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc17Q8CE13 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc17Q8CE13 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc17Q8CE13 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc17Q8CE13 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc17Q8CE13 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc17Q8CE13 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc17Q8CE13 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc17Q8CE13 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc17Q8CE13 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc17Q8CE13 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc17Q8CE13 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc17Q8CE13 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc17Q8CE13 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc17Q8CE13 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc17Q8CE13 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc17Q8CE13 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc17Q8CE13 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc17Q8CE13 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc17Q8CE13 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc17Q8CE13 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc17Q8CE13 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc17Q8CE13 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc17Q8CE13 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc17Q8CE13 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc17Q8CE13 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc17Q8CE13 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc17Q8CE13 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc17Q8CE13 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc17Q8CE13 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc17Q8CE13 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc17Q8CE13 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc17Q8CE13 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc17Q8CE13 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc17Q8CE13 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc17Q8CE13 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc17Q8CE13 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc17Q8CE13 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ccdc17Q8CE13 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ccdc17Q8CE13 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ccdc17Q8CE13 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc17Q8CE13 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc17Q8CE13 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc17Q8CE13 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc17Q8CE13 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc17Q8CE13 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc17Q8CE13 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc17Q8CE13 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc17Q8CE13 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc17Q8CE13 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc17Q8CE13 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc17Q8CE13 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc17Q8CE13 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc17Q8CE13 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc17Q8CE13 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc17Q8CE13 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc17Q8CE13 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc17Q8CE13 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc17Q8CE13 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc17Q8CE13 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc17Q8CE13 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc17Q8CE13 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc17Q8CE13 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc17Q8CE13 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc17Q8CE13 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc17Q8CE13 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.7 ms