Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCT7

Nsun3, tRNA (cytosine(34)-C(5))-methyltransferase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsun3Q8CCT7 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Nsun3Q8CCT7 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Nsun3Q8CCT7 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nsun3Q8CCT7 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nsun3Q8CCT7 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nsun3Q8CCT7 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Nsun3Q8CCT7 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Nsun3Q8CCT7 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Nsun3Q8CCT7 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nsun3Q8CCT7 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nsun3Q8CCT7 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nsun3Q8CCT7 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nsun3Q8CCT7 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nsun3Q8CCT7 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nsun3Q8CCT7 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nsun3Q8CCT7 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nsun3Q8CCT7 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Nsun3Q8CCT7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nsun3Q8CCT7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nsun3Q8CCT7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nsun3Q8CCT7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nsun3Q8CCT7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nsun3Q8CCT7 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nsun3Q8CCT7 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nsun3Q8CCT7 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nsun3Q8CCT7 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nsun3Q8CCT7 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nsun3Q8CCT7 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nsun3Q8CCT7 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nsun3Q8CCT7 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nsun3Q8CCT7 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nsun3Q8CCT7 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nsun3Q8CCT7 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nsun3Q8CCT7 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nsun3Q8CCT7 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nsun3Q8CCT7 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nsun3Q8CCT7 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nsun3Q8CCT7 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nsun3Q8CCT7 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Nsun3Q8CCT7 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nsun3Q8CCT7 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nsun3Q8CCT7 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nsun3Q8CCT7 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nsun3Q8CCT7 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nsun3Q8CCT7 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nsun3Q8CCT7 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nsun3Q8CCT7 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Nsun3Q8CCT7 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nsun3Q8CCT7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nsun3Q8CCT7 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nsun3Q8CCT7 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nsun3Q8CCT7 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nsun3Q8CCT7 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Nsun3Q8CCT7 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nsun3Q8CCT7 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nsun3Q8CCT7 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nsun3Q8CCT7 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nsun3Q8CCT7 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Nsun3Q8CCT7 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nsun3Q8CCT7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nsun3Q8CCT7 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nsun3Q8CCT7 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nsun3Q8CCT7 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nsun3Q8CCT7 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Nsun3Q8CCT7 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nsun3Q8CCT7 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nsun3Q8CCT7 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nsun3Q8CCT7 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Nsun3Q8CCT7 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nsun3Q8CCT7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nsun3Q8CCT7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nsun3Q8CCT7 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nsun3Q8CCT7 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nsun3Q8CCT7 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nsun3Q8CCT7 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Nsun3Q8CCT7 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nsun3Q8CCT7 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nsun3Q8CCT7 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nsun3Q8CCT7 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nsun3Q8CCT7 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nsun3Q8CCT7 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nsun3Q8CCT7 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Nsun3Q8CCT7 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Nsun3Q8CCT7 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nsun3Q8CCT7 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Nsun3Q8CCT7 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nsun3Q8CCT7 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nsun3Q8CCT7 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nsun3Q8CCT7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nsun3Q8CCT7 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nsun3Q8CCT7 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nsun3Q8CCT7 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nsun3Q8CCT7 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nsun3Q8CCT7 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nsun3Q8CCT7 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nsun3Q8CCT7 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nsun3Q8CCT7 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nsun3Q8CCT7 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nsun3Q8CCT7 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nsun3Q8CCT7 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
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