Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nhlrc3Q8CCH2 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nhlrc3Q8CCH2 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nhlrc3Q8CCH2 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nhlrc3Q8CCH2 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nhlrc3Q8CCH2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nhlrc3Q8CCH2 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nhlrc3Q8CCH2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nhlrc3Q8CCH2 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nhlrc3Q8CCH2 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Nhlrc3Q8CCH2 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Nhlrc3Q8CCH2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Nhlrc3Q8CCH2 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Nhlrc3Q8CCH2 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nhlrc3Q8CCH2 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nhlrc3Q8CCH2 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms