Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMG1

Atrip, ATR-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtripQ8BMG1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
AtripQ8BMG1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
AtripQ8BMG1 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
AtripQ8BMG1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
AtripQ8BMG1 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
AtripQ8BMG1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
AtripQ8BMG1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
AtripQ8BMG1 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
AtripQ8BMG1 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
AtripQ8BMG1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
AtripQ8BMG1 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
AtripQ8BMG1 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
AtripQ8BMG1 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
AtripQ8BMG1 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
AtripQ8BMG1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
AtripQ8BMG1 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
AtripQ8BMG1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
AtripQ8BMG1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
AtripQ8BMG1 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
AtripQ8BMG1 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
AtripQ8BMG1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
AtripQ8BMG1 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
AtripQ8BMG1 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
AtripQ8BMG1 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
AtripQ8BMG1 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
AtripQ8BMG1 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
AtripQ8BMG1 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
AtripQ8BMG1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
AtripQ8BMG1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
AtripQ8BMG1 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
AtripQ8BMG1 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
AtripQ8BMG1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
AtripQ8BMG1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AtripQ8BMG1 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AtripQ8BMG1 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
AtripQ8BMG1 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AtripQ8BMG1 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
AtripQ8BMG1 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AtripQ8BMG1 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AtripQ8BMG1 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AtripQ8BMG1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
AtripQ8BMG1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
AtripQ8BMG1 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
AtripQ8BMG1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
AtripQ8BMG1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
AtripQ8BMG1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
AtripQ8BMG1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
AtripQ8BMG1 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
AtripQ8BMG1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
AtripQ8BMG1 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
AtripQ8BMG1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
AtripQ8BMG1 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
AtripQ8BMG1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
AtripQ8BMG1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
AtripQ8BMG1 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
AtripQ8BMG1 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
AtripQ8BMG1 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
AtripQ8BMG1 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
AtripQ8BMG1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
AtripQ8BMG1 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
AtripQ8BMG1 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
AtripQ8BMG1 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
AtripQ8BMG1 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
AtripQ8BMG1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
AtripQ8BMG1 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
AtripQ8BMG1 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
AtripQ8BMG1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
AtripQ8BMG1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
AtripQ8BMG1 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
AtripQ8BMG1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
AtripQ8BMG1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
AtripQ8BMG1 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
AtripQ8BMG1 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
AtripQ8BMG1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
AtripQ8BMG1 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
AtripQ8BMG1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
AtripQ8BMG1 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
AtripQ8BMG1 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
AtripQ8BMG1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
AtripQ8BMG1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
AtripQ8BMG1 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
AtripQ8BMG1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
AtripQ8BMG1 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
AtripQ8BMG1 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
AtripQ8BMG1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
AtripQ8BMG1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
AtripQ8BMG1 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
AtripQ8BMG1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
AtripQ8BMG1 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
AtripQ8BMG1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
AtripQ8BMG1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
AtripQ8BMG1 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
AtripQ8BMG1 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
AtripQ8BMG1 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
AtripQ8BMG1 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
AtripQ8BMG1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
AtripQ8BMG1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
AtripQ8BMG1 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
AtripQ8BMG1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
AtripQ8BMG1 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms