Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH32

Susd4, Sushi domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd4Q8BH32 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Susd4Q8BH32 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
Susd4Q8BH32 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Susd4Q8BH32 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Susd4Q8BH32 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Susd4Q8BH32 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Susd4Q8BH32 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Susd4Q8BH32 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Susd4Q8BH32 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Susd4Q8BH32 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Susd4Q8BH32 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Susd4Q8BH32 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Susd4Q8BH32 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Susd4Q8BH32 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Susd4Q8BH32 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Susd4Q8BH32 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Susd4Q8BH32 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Susd4Q8BH32 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Susd4Q8BH32 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Susd4Q8BH32 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Susd4Q8BH32 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Susd4Q8BH32 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Susd4Q8BH32 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Susd4Q8BH32 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Susd4Q8BH32 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Susd4Q8BH32 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Susd4Q8BH32 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Susd4Q8BH32 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Susd4Q8BH32 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Susd4Q8BH32 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Susd4Q8BH32 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Susd4Q8BH32 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Susd4Q8BH32 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Susd4Q8BH32 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Susd4Q8BH32 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Susd4Q8BH32 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Susd4Q8BH32 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Susd4Q8BH32 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Susd4Q8BH32 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
Susd4Q8BH32 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Susd4Q8BH32 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Susd4Q8BH32 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Susd4Q8BH32 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Susd4Q8BH32 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Susd4Q8BH32 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Susd4Q8BH32 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Susd4Q8BH32 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Susd4Q8BH32 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Susd4Q8BH32 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Susd4Q8BH32 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Susd4Q8BH32 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Susd4Q8BH32 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Susd4Q8BH32 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Susd4Q8BH32 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Susd4Q8BH32 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Susd4Q8BH32 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Susd4Q8BH32 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Susd4Q8BH32 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Susd4Q8BH32 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Susd4Q8BH32 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Susd4Q8BH32 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Susd4Q8BH32 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Susd4Q8BH32 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Susd4Q8BH32 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Susd4Q8BH32 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Susd4Q8BH32 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Susd4Q8BH32 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Susd4Q8BH32 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Susd4Q8BH32 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Susd4Q8BH32 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Susd4Q8BH32 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Susd4Q8BH32 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Susd4Q8BH32 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Susd4Q8BH32 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Susd4Q8BH32 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Susd4Q8BH32 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Susd4Q8BH32 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Susd4Q8BH32 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Susd4Q8BH32 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Susd4Q8BH32 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Susd4Q8BH32 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Susd4Q8BH32 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Susd4Q8BH32 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Susd4Q8BH32 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Susd4Q8BH32 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Susd4Q8BH32 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Susd4Q8BH32 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.2
Susd4Q8BH32 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Susd4Q8BH32 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Susd4Q8BH32 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Susd4Q8BH32 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Susd4Q8BH32 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Susd4Q8BH32 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Susd4Q8BH32 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Susd4Q8BH32 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Susd4Q8BH32 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Susd4Q8BH32 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Susd4Q8BH32 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Susd4Q8BH32 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Susd4Q8BH32 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms