Protein–RNA interactions for Protein: Q80WQ9

Zbed4, Zinc finger BED domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed4Q80WQ9 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Zbed4Q80WQ9 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Zbed4Q80WQ9 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Zbed4Q80WQ9 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Zbed4Q80WQ9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Zbed4Q80WQ9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Zbed4Q80WQ9 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Zbed4Q80WQ9 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Zbed4Q80WQ9 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Zbed4Q80WQ9 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Zbed4Q80WQ9 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Zbed4Q80WQ9 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Zbed4Q80WQ9 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Zbed4Q80WQ9 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Zbed4Q80WQ9 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Zbed4Q80WQ9 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Zbed4Q80WQ9 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Zbed4Q80WQ9 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Zbed4Q80WQ9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Zbed4Q80WQ9 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Zbed4Q80WQ9 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Zbed4Q80WQ9 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Zbed4Q80WQ9 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Zbed4Q80WQ9 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Zbed4Q80WQ9 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Zbed4Q80WQ9 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Zbed4Q80WQ9 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Zbed4Q80WQ9 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Zbed4Q80WQ9 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Zbed4Q80WQ9 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Zbed4Q80WQ9 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Zbed4Q80WQ9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Zbed4Q80WQ9 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Zbed4Q80WQ9 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Zbed4Q80WQ9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Zbed4Q80WQ9 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Zbed4Q80WQ9 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Zbed4Q80WQ9 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Zbed4Q80WQ9 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Zbed4Q80WQ9 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Zbed4Q80WQ9 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Zbed4Q80WQ9 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Zbed4Q80WQ9 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Zbed4Q80WQ9 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Zbed4Q80WQ9 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Zbed4Q80WQ9 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Zbed4Q80WQ9 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Zbed4Q80WQ9 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Zbed4Q80WQ9 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Zbed4Q80WQ9 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Zbed4Q80WQ9 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Zbed4Q80WQ9 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Zbed4Q80WQ9 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Zbed4Q80WQ9 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Zbed4Q80WQ9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Zbed4Q80WQ9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Zbed4Q80WQ9 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Zbed4Q80WQ9 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Zbed4Q80WQ9 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Zbed4Q80WQ9 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Zbed4Q80WQ9 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Zbed4Q80WQ9 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Zbed4Q80WQ9 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Zbed4Q80WQ9 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Zbed4Q80WQ9 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Zbed4Q80WQ9 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Zbed4Q80WQ9 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Zbed4Q80WQ9 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Zbed4Q80WQ9 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Zbed4Q80WQ9 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Zbed4Q80WQ9 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Zbed4Q80WQ9 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Zbed4Q80WQ9 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Zbed4Q80WQ9 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Zbed4Q80WQ9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Zbed4Q80WQ9 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Zbed4Q80WQ9 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Zbed4Q80WQ9 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Zbed4Q80WQ9 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Zbed4Q80WQ9 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Zbed4Q80WQ9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Zbed4Q80WQ9 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Zbed4Q80WQ9 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Zbed4Q80WQ9 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Zbed4Q80WQ9 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Zbed4Q80WQ9 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Zbed4Q80WQ9 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Zbed4Q80WQ9 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Zbed4Q80WQ9 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Zbed4Q80WQ9 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Zbed4Q80WQ9 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Zbed4Q80WQ9 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Zbed4Q80WQ9 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Zbed4Q80WQ9 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Zbed4Q80WQ9 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Zbed4Q80WQ9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Zbed4Q80WQ9 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Zbed4Q80WQ9 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Zbed4Q80WQ9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Zbed4Q80WQ9 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms