Protein–RNA interactions for Protein: Q80V24

Vgll4, Transcription cofactor vestigial-like protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vgll4Q80V24 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vgll4Q80V24 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vgll4Q80V24 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vgll4Q80V24 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vgll4Q80V24 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vgll4Q80V24 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Vgll4Q80V24 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Vgll4Q80V24 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Vgll4Q80V24 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Vgll4Q80V24 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Vgll4Q80V24 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Vgll4Q80V24 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Vgll4Q80V24 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Vgll4Q80V24 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vgll4Q80V24 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vgll4Q80V24 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vgll4Q80V24 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vgll4Q80V24 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vgll4Q80V24 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vgll4Q80V24 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vgll4Q80V24 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Vgll4Q80V24 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vgll4Q80V24 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Vgll4Q80V24 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vgll4Q80V24 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vgll4Q80V24 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vgll4Q80V24 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vgll4Q80V24 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vgll4Q80V24 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vgll4Q80V24 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vgll4Q80V24 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vgll4Q80V24 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vgll4Q80V24 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vgll4Q80V24 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vgll4Q80V24 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Vgll4Q80V24 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Vgll4Q80V24 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vgll4Q80V24 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vgll4Q80V24 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vgll4Q80V24 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vgll4Q80V24 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vgll4Q80V24 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vgll4Q80V24 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Vgll4Q80V24 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vgll4Q80V24 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vgll4Q80V24 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vgll4Q80V24 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vgll4Q80V24 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vgll4Q80V24 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vgll4Q80V24 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vgll4Q80V24 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vgll4Q80V24 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vgll4Q80V24 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vgll4Q80V24 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vgll4Q80V24 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vgll4Q80V24 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vgll4Q80V24 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vgll4Q80V24 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vgll4Q80V24 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vgll4Q80V24 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vgll4Q80V24 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vgll4Q80V24 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vgll4Q80V24 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Vgll4Q80V24 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Vgll4Q80V24 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vgll4Q80V24 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vgll4Q80V24 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vgll4Q80V24 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Vgll4Q80V24 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Vgll4Q80V24 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vgll4Q80V24 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vgll4Q80V24 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vgll4Q80V24 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Vgll4Q80V24 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vgll4Q80V24 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vgll4Q80V24 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vgll4Q80V24 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Vgll4Q80V24 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Vgll4Q80V24 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Vgll4Q80V24 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vgll4Q80V24 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vgll4Q80V24 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vgll4Q80V24 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vgll4Q80V24 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vgll4Q80V24 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vgll4Q80V24 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vgll4Q80V24 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vgll4Q80V24 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vgll4Q80V24 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vgll4Q80V24 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vgll4Q80V24 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vgll4Q80V24 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vgll4Q80V24 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vgll4Q80V24 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vgll4Q80V24 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vgll4Q80V24 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Vgll4Q80V24 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Vgll4Q80V24 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vgll4Q80V24 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vgll4Q80V24 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms