Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNS5

B630019K06Rik, RIKEN cDNA B630019K06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B630019K06RikQ7TNS5 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
B630019K06RikQ7TNS5 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
B630019K06RikQ7TNS5 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
B630019K06RikQ7TNS5 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
B630019K06RikQ7TNS5 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
B630019K06RikQ7TNS5 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
B630019K06RikQ7TNS5 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
B630019K06RikQ7TNS5 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
B630019K06RikQ7TNS5 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
B630019K06RikQ7TNS5 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
B630019K06RikQ7TNS5 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
B630019K06RikQ7TNS5 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
B630019K06RikQ7TNS5 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
B630019K06RikQ7TNS5 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
B630019K06RikQ7TNS5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
B630019K06RikQ7TNS5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
B630019K06RikQ7TNS5 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
B630019K06RikQ7TNS5 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
B630019K06RikQ7TNS5 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
B630019K06RikQ7TNS5 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
B630019K06RikQ7TNS5 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
B630019K06RikQ7TNS5 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
B630019K06RikQ7TNS5 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
B630019K06RikQ7TNS5 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
B630019K06RikQ7TNS5 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
B630019K06RikQ7TNS5 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
B630019K06RikQ7TNS5 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
B630019K06RikQ7TNS5 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
B630019K06RikQ7TNS5 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
B630019K06RikQ7TNS5 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
B630019K06RikQ7TNS5 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
B630019K06RikQ7TNS5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
B630019K06RikQ7TNS5 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
B630019K06RikQ7TNS5 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
B630019K06RikQ7TNS5 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
B630019K06RikQ7TNS5 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
B630019K06RikQ7TNS5 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
B630019K06RikQ7TNS5 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
B630019K06RikQ7TNS5 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
B630019K06RikQ7TNS5 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
B630019K06RikQ7TNS5 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
B630019K06RikQ7TNS5 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
B630019K06RikQ7TNS5 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
B630019K06RikQ7TNS5 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
B630019K06RikQ7TNS5 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
B630019K06RikQ7TNS5 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
B630019K06RikQ7TNS5 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
B630019K06RikQ7TNS5 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
B630019K06RikQ7TNS5 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
B630019K06RikQ7TNS5 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
B630019K06RikQ7TNS5 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
B630019K06RikQ7TNS5 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
B630019K06RikQ7TNS5 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
B630019K06RikQ7TNS5 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
B630019K06RikQ7TNS5 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
B630019K06RikQ7TNS5 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
B630019K06RikQ7TNS5 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
B630019K06RikQ7TNS5 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
B630019K06RikQ7TNS5 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
B630019K06RikQ7TNS5 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
B630019K06RikQ7TNS5 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
B630019K06RikQ7TNS5 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
B630019K06RikQ7TNS5 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
B630019K06RikQ7TNS5 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
B630019K06RikQ7TNS5 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
B630019K06RikQ7TNS5 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
B630019K06RikQ7TNS5 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
B630019K06RikQ7TNS5 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
B630019K06RikQ7TNS5 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
B630019K06RikQ7TNS5 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
B630019K06RikQ7TNS5 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
B630019K06RikQ7TNS5 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
B630019K06RikQ7TNS5 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
B630019K06RikQ7TNS5 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
B630019K06RikQ7TNS5 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
B630019K06RikQ7TNS5 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
B630019K06RikQ7TNS5 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
B630019K06RikQ7TNS5 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
B630019K06RikQ7TNS5 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
B630019K06RikQ7TNS5 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
B630019K06RikQ7TNS5 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
B630019K06RikQ7TNS5 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
B630019K06RikQ7TNS5 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
B630019K06RikQ7TNS5 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
B630019K06RikQ7TNS5 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
B630019K06RikQ7TNS5 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
B630019K06RikQ7TNS5 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
B630019K06RikQ7TNS5 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
B630019K06RikQ7TNS5 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
B630019K06RikQ7TNS5 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
B630019K06RikQ7TNS5 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
B630019K06RikQ7TNS5 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
B630019K06RikQ7TNS5 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
B630019K06RikQ7TNS5 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
B630019K06RikQ7TNS5 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
B630019K06RikQ7TNS5 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
B630019K06RikQ7TNS5 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
B630019K06RikQ7TNS5 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
B630019K06RikQ7TNS5 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
B630019K06RikQ7TNS5 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms