Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS8

Spop, Speckle-type POZ protein, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SpopQ6ZWS8 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SpopQ6ZWS8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SpopQ6ZWS8 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SpopQ6ZWS8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SpopQ6ZWS8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SpopQ6ZWS8 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SpopQ6ZWS8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SpopQ6ZWS8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SpopQ6ZWS8 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SpopQ6ZWS8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SpopQ6ZWS8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SpopQ6ZWS8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SpopQ6ZWS8 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SpopQ6ZWS8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SpopQ6ZWS8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SpopQ6ZWS8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SpopQ6ZWS8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SpopQ6ZWS8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SpopQ6ZWS8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SpopQ6ZWS8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SpopQ6ZWS8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SpopQ6ZWS8 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SpopQ6ZWS8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SpopQ6ZWS8 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SpopQ6ZWS8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SpopQ6ZWS8 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SpopQ6ZWS8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SpopQ6ZWS8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SpopQ6ZWS8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SpopQ6ZWS8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SpopQ6ZWS8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SpopQ6ZWS8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SpopQ6ZWS8 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SpopQ6ZWS8 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SpopQ6ZWS8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SpopQ6ZWS8 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SpopQ6ZWS8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SpopQ6ZWS8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SpopQ6ZWS8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SpopQ6ZWS8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SpopQ6ZWS8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SpopQ6ZWS8 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SpopQ6ZWS8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SpopQ6ZWS8 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SpopQ6ZWS8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SpopQ6ZWS8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SpopQ6ZWS8 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SpopQ6ZWS8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SpopQ6ZWS8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SpopQ6ZWS8 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SpopQ6ZWS8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SpopQ6ZWS8 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SpopQ6ZWS8 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SpopQ6ZWS8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SpopQ6ZWS8 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SpopQ6ZWS8 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SpopQ6ZWS8 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SpopQ6ZWS8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SpopQ6ZWS8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SpopQ6ZWS8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SpopQ6ZWS8 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SpopQ6ZWS8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SpopQ6ZWS8 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SpopQ6ZWS8 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SpopQ6ZWS8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SpopQ6ZWS8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SpopQ6ZWS8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SpopQ6ZWS8 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SpopQ6ZWS8 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SpopQ6ZWS8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SpopQ6ZWS8 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SpopQ6ZWS8 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SpopQ6ZWS8 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SpopQ6ZWS8 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SpopQ6ZWS8 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SpopQ6ZWS8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SpopQ6ZWS8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SpopQ6ZWS8 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SpopQ6ZWS8 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SpopQ6ZWS8 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SpopQ6ZWS8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SpopQ6ZWS8 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SpopQ6ZWS8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SpopQ6ZWS8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SpopQ6ZWS8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SpopQ6ZWS8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SpopQ6ZWS8 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SpopQ6ZWS8 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SpopQ6ZWS8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SpopQ6ZWS8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SpopQ6ZWS8 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SpopQ6ZWS8 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SpopQ6ZWS8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SpopQ6ZWS8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SpopQ6ZWS8 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SpopQ6ZWS8 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SpopQ6ZWS8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SpopQ6ZWS8 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SpopQ6ZWS8 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SpopQ6ZWS8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.2 ms