Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAS4

Ssxb3, SSXB3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb3Q6XAS4 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ssxb3Q6XAS4 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ssxb3Q6XAS4 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ssxb3Q6XAS4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ssxb3Q6XAS4 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ssxb3Q6XAS4 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ssxb3Q6XAS4 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ssxb3Q6XAS4 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Ssxb3Q6XAS4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ssxb3Q6XAS4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ssxb3Q6XAS4 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ssxb3Q6XAS4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ssxb3Q6XAS4 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ssxb3Q6XAS4 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ssxb3Q6XAS4 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ssxb3Q6XAS4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ssxb3Q6XAS4 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ssxb3Q6XAS4 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ssxb3Q6XAS4 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ssxb3Q6XAS4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ssxb3Q6XAS4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ssxb3Q6XAS4 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ssxb3Q6XAS4 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ssxb3Q6XAS4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ssxb3Q6XAS4 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ssxb3Q6XAS4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ssxb3Q6XAS4 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ssxb3Q6XAS4 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ssxb3Q6XAS4 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ssxb3Q6XAS4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ssxb3Q6XAS4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ssxb3Q6XAS4 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ssxb3Q6XAS4 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ssxb3Q6XAS4 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Ssxb3Q6XAS4 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ssxb3Q6XAS4 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ssxb3Q6XAS4 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ssxb3Q6XAS4 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ssxb3Q6XAS4 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ssxb3Q6XAS4 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ssxb3Q6XAS4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ssxb3Q6XAS4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ssxb3Q6XAS4 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ssxb3Q6XAS4 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ssxb3Q6XAS4 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ssxb3Q6XAS4 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ssxb3Q6XAS4 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ssxb3Q6XAS4 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ssxb3Q6XAS4 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ssxb3Q6XAS4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ssxb3Q6XAS4 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ssxb3Q6XAS4 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ssxb3Q6XAS4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ssxb3Q6XAS4 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ssxb3Q6XAS4 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ssxb3Q6XAS4 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ssxb3Q6XAS4 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ssxb3Q6XAS4 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ssxb3Q6XAS4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ssxb3Q6XAS4 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ssxb3Q6XAS4 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ssxb3Q6XAS4 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ssxb3Q6XAS4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ssxb3Q6XAS4 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ssxb3Q6XAS4 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ssxb3Q6XAS4 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ssxb3Q6XAS4 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Ssxb3Q6XAS4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ssxb3Q6XAS4 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ssxb3Q6XAS4 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ssxb3Q6XAS4 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ssxb3Q6XAS4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ssxb3Q6XAS4 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ssxb3Q6XAS4 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ssxb3Q6XAS4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ssxb3Q6XAS4 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ssxb3Q6XAS4 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ssxb3Q6XAS4 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ssxb3Q6XAS4 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ssxb3Q6XAS4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ssxb3Q6XAS4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ssxb3Q6XAS4 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ssxb3Q6XAS4 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ssxb3Q6XAS4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ssxb3Q6XAS4 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Ssxb3Q6XAS4 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ssxb3Q6XAS4 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ssxb3Q6XAS4 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ssxb3Q6XAS4 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ssxb3Q6XAS4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ssxb3Q6XAS4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ssxb3Q6XAS4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ssxb3Q6XAS4 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ssxb3Q6XAS4 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ssxb3Q6XAS4 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ssxb3Q6XAS4 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ssxb3Q6XAS4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ssxb3Q6XAS4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ssxb3Q6XAS4 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ssxb3Q6XAS4 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms