Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEM6

Gramd2b, GRAM domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gramd2bQ6PEM6 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gramd2bQ6PEM6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gramd2bQ6PEM6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gramd2bQ6PEM6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gramd2bQ6PEM6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gramd2bQ6PEM6 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gramd2bQ6PEM6 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gramd2bQ6PEM6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gramd2bQ6PEM6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gramd2bQ6PEM6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gramd2bQ6PEM6 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gramd2bQ6PEM6 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gramd2bQ6PEM6 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gramd2bQ6PEM6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gramd2bQ6PEM6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gramd2bQ6PEM6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gramd2bQ6PEM6 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gramd2bQ6PEM6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gramd2bQ6PEM6 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gramd2bQ6PEM6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gramd2bQ6PEM6 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gramd2bQ6PEM6 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gramd2bQ6PEM6 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gramd2bQ6PEM6 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gramd2bQ6PEM6 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gramd2bQ6PEM6 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gramd2bQ6PEM6 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gramd2bQ6PEM6 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gramd2bQ6PEM6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gramd2bQ6PEM6 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gramd2bQ6PEM6 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gramd2bQ6PEM6 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gramd2bQ6PEM6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gramd2bQ6PEM6 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gramd2bQ6PEM6 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gramd2bQ6PEM6 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gramd2bQ6PEM6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Gramd2bQ6PEM6 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gramd2bQ6PEM6 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gramd2bQ6PEM6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gramd2bQ6PEM6 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gramd2bQ6PEM6 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Gramd2bQ6PEM6 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gramd2bQ6PEM6 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gramd2bQ6PEM6 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gramd2bQ6PEM6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gramd2bQ6PEM6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gramd2bQ6PEM6 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gramd2bQ6PEM6 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gramd2bQ6PEM6 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gramd2bQ6PEM6 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gramd2bQ6PEM6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gramd2bQ6PEM6 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gramd2bQ6PEM6 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gramd2bQ6PEM6 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gramd2bQ6PEM6 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gramd2bQ6PEM6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gramd2bQ6PEM6 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gramd2bQ6PEM6 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gramd2bQ6PEM6 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gramd2bQ6PEM6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gramd2bQ6PEM6 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gramd2bQ6PEM6 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gramd2bQ6PEM6 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gramd2bQ6PEM6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gramd2bQ6PEM6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gramd2bQ6PEM6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gramd2bQ6PEM6 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gramd2bQ6PEM6 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gramd2bQ6PEM6 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gramd2bQ6PEM6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gramd2bQ6PEM6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gramd2bQ6PEM6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gramd2bQ6PEM6 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gramd2bQ6PEM6 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gramd2bQ6PEM6 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gramd2bQ6PEM6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gramd2bQ6PEM6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gramd2bQ6PEM6 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gramd2bQ6PEM6 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gramd2bQ6PEM6 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gramd2bQ6PEM6 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gramd2bQ6PEM6 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gramd2bQ6PEM6 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Gramd2bQ6PEM6 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Gramd2bQ6PEM6 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gramd2bQ6PEM6 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gramd2bQ6PEM6 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gramd2bQ6PEM6 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gramd2bQ6PEM6 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gramd2bQ6PEM6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gramd2bQ6PEM6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gramd2bQ6PEM6 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gramd2bQ6PEM6 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gramd2bQ6PEM6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gramd2bQ6PEM6 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gramd2bQ6PEM6 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gramd2bQ6PEM6 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gramd2bQ6PEM6 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Gramd2bQ6PEM6 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms