Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZM9

Hdac4, Histone deacetylase 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,076 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac4Q6NZM9 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Hdac4Q6NZM9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Hdac4Q6NZM9 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Hdac4Q6NZM9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Hdac4Q6NZM9 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Hdac4Q6NZM9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Hdac4Q6NZM9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Hdac4Q6NZM9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Hdac4Q6NZM9 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Hdac4Q6NZM9 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Hdac4Q6NZM9 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Hdac4Q6NZM9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Hdac4Q6NZM9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Hdac4Q6NZM9 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Hdac4Q6NZM9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Hdac4Q6NZM9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Hdac4Q6NZM9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Hdac4Q6NZM9 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Hdac4Q6NZM9 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Hdac4Q6NZM9 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Hdac4Q6NZM9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Hdac4Q6NZM9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Hdac4Q6NZM9 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Hdac4Q6NZM9 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Hdac4Q6NZM9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Hdac4Q6NZM9 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Hdac4Q6NZM9 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Hdac4Q6NZM9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Hdac4Q6NZM9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Hdac4Q6NZM9 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Hdac4Q6NZM9 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Hdac4Q6NZM9 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Hdac4Q6NZM9 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Hdac4Q6NZM9 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Hdac4Q6NZM9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Hdac4Q6NZM9 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Hdac4Q6NZM9 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Hdac4Q6NZM9 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Hdac4Q6NZM9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Hdac4Q6NZM9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Hdac4Q6NZM9 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Hdac4Q6NZM9 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Hdac4Q6NZM9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Hdac4Q6NZM9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Hdac4Q6NZM9 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Hdac4Q6NZM9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Hdac4Q6NZM9 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Hdac4Q6NZM9 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Hdac4Q6NZM9 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Hdac4Q6NZM9 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Hdac4Q6NZM9 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Hdac4Q6NZM9 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Hdac4Q6NZM9 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Hdac4Q6NZM9 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Hdac4Q6NZM9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Hdac4Q6NZM9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Hdac4Q6NZM9 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Hdac4Q6NZM9 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Hdac4Q6NZM9 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Hdac4Q6NZM9 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Hdac4Q6NZM9 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Hdac4Q6NZM9 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Hdac4Q6NZM9 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Hdac4Q6NZM9 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Hdac4Q6NZM9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Hdac4Q6NZM9 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Hdac4Q6NZM9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Hdac4Q6NZM9 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Hdac4Q6NZM9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Hdac4Q6NZM9 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Hdac4Q6NZM9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Hdac4Q6NZM9 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Hdac4Q6NZM9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Hdac4Q6NZM9 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Hdac4Q6NZM9 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Hdac4Q6NZM9 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Hdac4Q6NZM9 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Hdac4Q6NZM9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Hdac4Q6NZM9 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Hdac4Q6NZM9 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Hdac4Q6NZM9 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Hdac4Q6NZM9 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Hdac4Q6NZM9 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Hdac4Q6NZM9 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Hdac4Q6NZM9 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Hdac4Q6NZM9 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Hdac4Q6NZM9 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Hdac4Q6NZM9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Hdac4Q6NZM9 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Hdac4Q6NZM9 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Hdac4Q6NZM9 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Hdac4Q6NZM9 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Hdac4Q6NZM9 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Hdac4Q6NZM9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Hdac4Q6NZM9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Hdac4Q6NZM9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Hdac4Q6NZM9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Hdac4Q6NZM9 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Hdac4Q6NZM9 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Hdac4Q6NZM9 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.3 ms