Protein–RNA interactions for Protein: Q6A078

Cep290, Centrosomal protein of 290 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 2,472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep290Q6A078 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Cep290Q6A078 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cep290Q6A078 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cep290Q6A078 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cep290Q6A078 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cep290Q6A078 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cep290Q6A078 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cep290Q6A078 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cep290Q6A078 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cep290Q6A078 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cep290Q6A078 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cep290Q6A078 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cep290Q6A078 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cep290Q6A078 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cep290Q6A078 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cep290Q6A078 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cep290Q6A078 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cep290Q6A078 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cep290Q6A078 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Cep290Q6A078 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cep290Q6A078 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cep290Q6A078 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cep290Q6A078 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cep290Q6A078 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cep290Q6A078 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cep290Q6A078 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cep290Q6A078 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cep290Q6A078 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cep290Q6A078 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cep290Q6A078 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cep290Q6A078 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cep290Q6A078 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cep290Q6A078 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cep290Q6A078 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cep290Q6A078 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cep290Q6A078 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cep290Q6A078 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cep290Q6A078 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cep290Q6A078 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cep290Q6A078 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Cep290Q6A078 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cep290Q6A078 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cep290Q6A078 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cep290Q6A078 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cep290Q6A078 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cep290Q6A078 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cep290Q6A078 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cep290Q6A078 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cep290Q6A078 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cep290Q6A078 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Cep290Q6A078 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cep290Q6A078 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cep290Q6A078 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cep290Q6A078 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Cep290Q6A078 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cep290Q6A078 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cep290Q6A078 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cep290Q6A078 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cep290Q6A078 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cep290Q6A078 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Cep290Q6A078 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cep290Q6A078 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cep290Q6A078 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cep290Q6A078 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Cep290Q6A078 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cep290Q6A078 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cep290Q6A078 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cep290Q6A078 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cep290Q6A078 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cep290Q6A078 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cep290Q6A078 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cep290Q6A078 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Cep290Q6A078 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cep290Q6A078 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cep290Q6A078 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cep290Q6A078 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cep290Q6A078 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cep290Q6A078 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cep290Q6A078 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cep290Q6A078 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cep290Q6A078 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cep290Q6A078 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Cep290Q6A078 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cep290Q6A078 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Cep290Q6A078 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cep290Q6A078 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cep290Q6A078 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cep290Q6A078 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cep290Q6A078 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cep290Q6A078 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cep290Q6A078 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Cep290Q6A078 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cep290Q6A078 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cep290Q6A078 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Cep290Q6A078 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cep290Q6A078 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cep290Q6A078 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cep290Q6A078 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cep290Q6A078 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Cep290Q6A078 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms