Protein–RNA interactions for Protein: Q6A065

Cep170, Centrosomal protein of 170 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep170Q6A065 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC37.43■■■■□ 3.58
Cep170Q6A065 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
Cep170Q6A065 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.42■■■■□ 3.58
Cep170Q6A065 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC37.42■■■■□ 3.58
Cep170Q6A065 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC37.41■■■■□ 3.58
Cep170Q6A065 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC37.4■■■■□ 3.58
Cep170Q6A065 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
Cep170Q6A065 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.58
Cep170Q6A065 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
Cep170Q6A065 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC37.37■■■■□ 3.57
Cep170Q6A065 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
Cep170Q6A065 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC37.36■■■■□ 3.57
Cep170Q6A065 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.35■■■■□ 3.57
Cep170Q6A065 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
Cep170Q6A065 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC37.34■■■■□ 3.57
Cep170Q6A065 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
Cep170Q6A065 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.32■■■■□ 3.57
Cep170Q6A065 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC37.31■■■■□ 3.56
Cep170Q6A065 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC37.31■■■■□ 3.56
Cep170Q6A065 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC37.31■■■■□ 3.56
Cep170Q6A065 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC37.3■■■■□ 3.56
Cep170Q6A065 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
Cep170Q6A065 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC37.29■■■■□ 3.56
Cep170Q6A065 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
Cep170Q6A065 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC37.27■■■■□ 3.56
Cep170Q6A065 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
Cep170Q6A065 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC37.26■■■■□ 3.56
Cep170Q6A065 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC37.26■■■■□ 3.56
Cep170Q6A065 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
Cep170Q6A065 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
Cep170Q6A065 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC37.25■■■■□ 3.55
Cep170Q6A065 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
Cep170Q6A065 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC37.25■■■■□ 3.55
Cep170Q6A065 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC37.24■■■■□ 3.55
Cep170Q6A065 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
Cep170Q6A065 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.23■■■■□ 3.55
Cep170Q6A065 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC37.23■■■■□ 3.55
Cep170Q6A065 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
Cep170Q6A065 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC37.22■■■■□ 3.55
Cep170Q6A065 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC37.22■■■■□ 3.55
Cep170Q6A065 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
Cep170Q6A065 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.22■■■■□ 3.55
Cep170Q6A065 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
Cep170Q6A065 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC37.21■■■■□ 3.55
Cep170Q6A065 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
Cep170Q6A065 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.55
Cep170Q6A065 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.19■■■■□ 3.54
Cep170Q6A065 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
Cep170Q6A065 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC37.17■■■■□ 3.54
Cep170Q6A065 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC37.17■■■■□ 3.54
Cep170Q6A065 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.16■■■■□ 3.54
Cep170Q6A065 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
Cep170Q6A065 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
Cep170Q6A065 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
Cep170Q6A065 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
Cep170Q6A065 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC37.14■■■■□ 3.54
Cep170Q6A065 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
Cep170Q6A065 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC37.13■■■■□ 3.53
Cep170Q6A065 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.13■■■■□ 3.53
Cep170Q6A065 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
Cep170Q6A065 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC37.12■■■■□ 3.53
Cep170Q6A065 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
Cep170Q6A065 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC37.12■■■■□ 3.53
Cep170Q6A065 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
Cep170Q6A065 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
Cep170Q6A065 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
Cep170Q6A065 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
Cep170Q6A065 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
Cep170Q6A065 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.08■■■■□ 3.53
Cep170Q6A065 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC37.08■■■■□ 3.53
Cep170Q6A065 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
Cep170Q6A065 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC37.08■■■■□ 3.53
Cep170Q6A065 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.07■■■■□ 3.53
Cep170Q6A065 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
Cep170Q6A065 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC37.07■■■■□ 3.52
Cep170Q6A065 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
Cep170Q6A065 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.06■■■■□ 3.52
Cep170Q6A065 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
Cep170Q6A065 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC37.06■■■■□ 3.52
Cep170Q6A065 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC37.06■■■■□ 3.52
Cep170Q6A065 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC37.06■■■■□ 3.52
Cep170Q6A065 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
Cep170Q6A065 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
Cep170Q6A065 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
Cep170Q6A065 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
Cep170Q6A065 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
Cep170Q6A065 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
Cep170Q6A065 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
Cep170Q6A065 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.02■■■■□ 3.52
Cep170Q6A065 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC37.01■■■■□ 3.52
Cep170Q6A065 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC37■■■■□ 3.51
Cep170Q6A065 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
Cep170Q6A065 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37■■■■□ 3.51
Cep170Q6A065 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC37■■■■□ 3.51
Cep170Q6A065 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC37■■■■□ 3.51
Cep170Q6A065 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
Cep170Q6A065 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
Cep170Q6A065 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
Cep170Q6A065 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
Cep170Q6A065 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms