Protein–RNA interactions for Protein: Q6A009

Ltn1, E3 ubiquitin-protein ligase listerin, mousemouse

Predictions only

Length 1,767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ltn1Q6A009 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Ltn1Q6A009 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ltn1Q6A009 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ltn1Q6A009 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Ltn1Q6A009 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ltn1Q6A009 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ltn1Q6A009 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ltn1Q6A009 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ltn1Q6A009 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ltn1Q6A009 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ltn1Q6A009 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ltn1Q6A009 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ltn1Q6A009 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Ltn1Q6A009 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ltn1Q6A009 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ltn1Q6A009 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ltn1Q6A009 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ltn1Q6A009 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ltn1Q6A009 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ltn1Q6A009 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Ltn1Q6A009 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ltn1Q6A009 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ltn1Q6A009 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ltn1Q6A009 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ltn1Q6A009 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ltn1Q6A009 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ltn1Q6A009 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Ltn1Q6A009 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ltn1Q6A009 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ltn1Q6A009 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ltn1Q6A009 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ltn1Q6A009 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ltn1Q6A009 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ltn1Q6A009 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Ltn1Q6A009 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
Ltn1Q6A009 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ltn1Q6A009 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ltn1Q6A009 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ltn1Q6A009 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Ltn1Q6A009 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ltn1Q6A009 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ltn1Q6A009 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ltn1Q6A009 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ltn1Q6A009 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ltn1Q6A009 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ltn1Q6A009 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ltn1Q6A009 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ltn1Q6A009 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ltn1Q6A009 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ltn1Q6A009 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ltn1Q6A009 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ltn1Q6A009 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ltn1Q6A009 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Ltn1Q6A009 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Ltn1Q6A009 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ltn1Q6A009 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ltn1Q6A009 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ltn1Q6A009 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ltn1Q6A009 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ltn1Q6A009 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ltn1Q6A009 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ltn1Q6A009 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ltn1Q6A009 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ltn1Q6A009 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ltn1Q6A009 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ltn1Q6A009 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ltn1Q6A009 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ltn1Q6A009 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ltn1Q6A009 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ltn1Q6A009 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ltn1Q6A009 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ltn1Q6A009 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Ltn1Q6A009 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ltn1Q6A009 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Ltn1Q6A009 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ltn1Q6A009 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ltn1Q6A009 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ltn1Q6A009 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ltn1Q6A009 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ltn1Q6A009 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ltn1Q6A009 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ltn1Q6A009 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ltn1Q6A009 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ltn1Q6A009 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ltn1Q6A009 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Ltn1Q6A009 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ltn1Q6A009 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ltn1Q6A009 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ltn1Q6A009 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ltn1Q6A009 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ltn1Q6A009 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ltn1Q6A009 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ltn1Q6A009 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ltn1Q6A009 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
Ltn1Q6A009 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ltn1Q6A009 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Ltn1Q6A009 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ltn1Q6A009 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ltn1Q6A009 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ltn1Q6A009 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms