Protein–RNA interactions for Protein: Q62432

Smad2, Mothers against decapentaplegic homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad2Q62432 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Smad2Q62432 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Smad2Q62432 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Smad2Q62432 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Smad2Q62432 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Smad2Q62432 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Smad2Q62432 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Smad2Q62432 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Smad2Q62432 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Smad2Q62432 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smad2Q62432 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smad2Q62432 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smad2Q62432 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Smad2Q62432 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Smad2Q62432 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Smad2Q62432 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Smad2Q62432 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Smad2Q62432 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Smad2Q62432 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Smad2Q62432 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Smad2Q62432 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Smad2Q62432 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Smad2Q62432 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Smad2Q62432 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smad2Q62432 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smad2Q62432 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smad2Q62432 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Smad2Q62432 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Smad2Q62432 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Smad2Q62432 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Smad2Q62432 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Smad2Q62432 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Smad2Q62432 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Smad2Q62432 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Smad2Q62432 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Smad2Q62432 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Smad2Q62432 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Smad2Q62432 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Smad2Q62432 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Smad2Q62432 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Smad2Q62432 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Smad2Q62432 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Smad2Q62432 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Smad2Q62432 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Smad2Q62432 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Smad2Q62432 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Smad2Q62432 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Smad2Q62432 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Smad2Q62432 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Smad2Q62432 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Smad2Q62432 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Smad2Q62432 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Smad2Q62432 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Smad2Q62432 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Smad2Q62432 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Smad2Q62432 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Smad2Q62432 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Smad2Q62432 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Smad2Q62432 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Smad2Q62432 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Smad2Q62432 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smad2Q62432 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Smad2Q62432 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Smad2Q62432 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Smad2Q62432 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Smad2Q62432 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Smad2Q62432 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Smad2Q62432 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Smad2Q62432 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Smad2Q62432 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Smad2Q62432 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Smad2Q62432 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Smad2Q62432 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Smad2Q62432 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Smad2Q62432 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Smad2Q62432 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Smad2Q62432 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Smad2Q62432 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Smad2Q62432 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Smad2Q62432 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Smad2Q62432 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Smad2Q62432 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Smad2Q62432 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Smad2Q62432 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Smad2Q62432 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Smad2Q62432 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Smad2Q62432 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Smad2Q62432 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Smad2Q62432 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Smad2Q62432 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Smad2Q62432 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Smad2Q62432 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Smad2Q62432 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Smad2Q62432 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Smad2Q62432 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Smad2Q62432 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Smad2Q62432 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Smad2Q62432 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Smad2Q62432 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Smad2Q62432 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 126.3 ms