Protein–RNA interactions for Protein: Q61539

Esrrb, Steroid hormone receptor ERR2, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EsrrbQ61539 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EsrrbQ61539 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EsrrbQ61539 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
EsrrbQ61539 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
EsrrbQ61539 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
EsrrbQ61539 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
EsrrbQ61539 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EsrrbQ61539 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EsrrbQ61539 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EsrrbQ61539 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EsrrbQ61539 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EsrrbQ61539 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EsrrbQ61539 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EsrrbQ61539 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
EsrrbQ61539 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EsrrbQ61539 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EsrrbQ61539 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
EsrrbQ61539 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
EsrrbQ61539 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
EsrrbQ61539 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EsrrbQ61539 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EsrrbQ61539 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EsrrbQ61539 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EsrrbQ61539 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EsrrbQ61539 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EsrrbQ61539 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EsrrbQ61539 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EsrrbQ61539 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EsrrbQ61539 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EsrrbQ61539 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EsrrbQ61539 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EsrrbQ61539 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EsrrbQ61539 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EsrrbQ61539 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EsrrbQ61539 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EsrrbQ61539 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EsrrbQ61539 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EsrrbQ61539 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
EsrrbQ61539 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EsrrbQ61539 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EsrrbQ61539 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EsrrbQ61539 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EsrrbQ61539 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EsrrbQ61539 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EsrrbQ61539 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EsrrbQ61539 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EsrrbQ61539 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EsrrbQ61539 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EsrrbQ61539 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EsrrbQ61539 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EsrrbQ61539 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EsrrbQ61539 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EsrrbQ61539 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EsrrbQ61539 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EsrrbQ61539 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EsrrbQ61539 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EsrrbQ61539 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EsrrbQ61539 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EsrrbQ61539 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EsrrbQ61539 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EsrrbQ61539 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EsrrbQ61539 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EsrrbQ61539 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EsrrbQ61539 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EsrrbQ61539 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EsrrbQ61539 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EsrrbQ61539 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EsrrbQ61539 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EsrrbQ61539 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EsrrbQ61539 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
EsrrbQ61539 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
EsrrbQ61539 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EsrrbQ61539 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EsrrbQ61539 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EsrrbQ61539 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EsrrbQ61539 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
EsrrbQ61539 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EsrrbQ61539 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EsrrbQ61539 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EsrrbQ61539 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EsrrbQ61539 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EsrrbQ61539 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EsrrbQ61539 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EsrrbQ61539 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EsrrbQ61539 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EsrrbQ61539 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EsrrbQ61539 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EsrrbQ61539 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EsrrbQ61539 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EsrrbQ61539 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EsrrbQ61539 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EsrrbQ61539 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EsrrbQ61539 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EsrrbQ61539 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EsrrbQ61539 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EsrrbQ61539 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EsrrbQ61539 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EsrrbQ61539 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EsrrbQ61539 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EsrrbQ61539 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms