Protein–RNA interactions for Protein: Q61286

Tcf12, Transcription factor 12, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcf12Q61286 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tcf12Q61286 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tcf12Q61286 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tcf12Q61286 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tcf12Q61286 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Tcf12Q61286 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tcf12Q61286 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tcf12Q61286 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tcf12Q61286 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tcf12Q61286 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tcf12Q61286 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tcf12Q61286 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tcf12Q61286 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tcf12Q61286 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tcf12Q61286 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tcf12Q61286 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tcf12Q61286 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tcf12Q61286 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Tcf12Q61286 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tcf12Q61286 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tcf12Q61286 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tcf12Q61286 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tcf12Q61286 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tcf12Q61286 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tcf12Q61286 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tcf12Q61286 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tcf12Q61286 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Tcf12Q61286 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Tcf12Q61286 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
Tcf12Q61286 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Tcf12Q61286 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tcf12Q61286 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tcf12Q61286 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Tcf12Q61286 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tcf12Q61286 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tcf12Q61286 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tcf12Q61286 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Tcf12Q61286 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tcf12Q61286 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Tcf12Q61286 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tcf12Q61286 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tcf12Q61286 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tcf12Q61286 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tcf12Q61286 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tcf12Q61286 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Tcf12Q61286 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tcf12Q61286 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Tcf12Q61286 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tcf12Q61286 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tcf12Q61286 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tcf12Q61286 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tcf12Q61286 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Tcf12Q61286 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tcf12Q61286 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tcf12Q61286 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tcf12Q61286 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tcf12Q61286 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tcf12Q61286 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tcf12Q61286 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tcf12Q61286 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tcf12Q61286 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tcf12Q61286 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tcf12Q61286 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tcf12Q61286 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tcf12Q61286 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tcf12Q61286 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tcf12Q61286 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tcf12Q61286 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tcf12Q61286 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tcf12Q61286 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tcf12Q61286 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Tcf12Q61286 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tcf12Q61286 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tcf12Q61286 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tcf12Q61286 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tcf12Q61286 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tcf12Q61286 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Tcf12Q61286 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tcf12Q61286 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tcf12Q61286 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tcf12Q61286 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tcf12Q61286 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tcf12Q61286 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tcf12Q61286 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tcf12Q61286 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tcf12Q61286 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tcf12Q61286 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tcf12Q61286 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Tcf12Q61286 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tcf12Q61286 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tcf12Q61286 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tcf12Q61286 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tcf12Q61286 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tcf12Q61286 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tcf12Q61286 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tcf12Q61286 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tcf12Q61286 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Tcf12Q61286 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tcf12Q61286 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tcf12Q61286 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.1 ms