Protein–RNA interactions for Protein: Q61220

Nell2, Protein kinase C-binding protein NELL2, mousemouse

Predictions only

Length 819 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nell2Q61220 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Nell2Q61220 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Nell2Q61220 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Nell2Q61220 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Nell2Q61220 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Nell2Q61220 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Nell2Q61220 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Nell2Q61220 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Nell2Q61220 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Nell2Q61220 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Nell2Q61220 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Nell2Q61220 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Nell2Q61220 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Nell2Q61220 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
Nell2Q61220 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Nell2Q61220 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Nell2Q61220 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Nell2Q61220 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Nell2Q61220 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Nell2Q61220 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Nell2Q61220 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Nell2Q61220 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Nell2Q61220 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Nell2Q61220 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Nell2Q61220 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Nell2Q61220 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Nell2Q61220 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Nell2Q61220 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Nell2Q61220 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Nell2Q61220 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Nell2Q61220 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Nell2Q61220 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Nell2Q61220 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Nell2Q61220 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Nell2Q61220 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Nell2Q61220 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Nell2Q61220 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Nell2Q61220 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Nell2Q61220 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Nell2Q61220 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Nell2Q61220 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Nell2Q61220 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Nell2Q61220 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Nell2Q61220 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Nell2Q61220 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Nell2Q61220 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Nell2Q61220 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Nell2Q61220 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Nell2Q61220 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Nell2Q61220 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Nell2Q61220 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Nell2Q61220 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Nell2Q61220 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Nell2Q61220 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Nell2Q61220 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Nell2Q61220 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Nell2Q61220 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Nell2Q61220 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Nell2Q61220 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Nell2Q61220 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Nell2Q61220 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Nell2Q61220 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Nell2Q61220 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Nell2Q61220 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Nell2Q61220 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Nell2Q61220 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Nell2Q61220 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Nell2Q61220 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Nell2Q61220 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Nell2Q61220 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Nell2Q61220 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Nell2Q61220 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Nell2Q61220 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Nell2Q61220 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Nell2Q61220 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Nell2Q61220 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Nell2Q61220 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Nell2Q61220 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Nell2Q61220 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Nell2Q61220 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Nell2Q61220 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Nell2Q61220 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Nell2Q61220 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Nell2Q61220 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Nell2Q61220 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Nell2Q61220 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Nell2Q61220 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Nell2Q61220 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Nell2Q61220 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Nell2Q61220 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Nell2Q61220 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Nell2Q61220 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Nell2Q61220 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Nell2Q61220 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Nell2Q61220 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Nell2Q61220 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Nell2Q61220 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Nell2Q61220 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Nell2Q61220 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Nell2Q61220 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms