Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4C3

Scaf1, Splicing factor, arginine/serine-rich 19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf1Q5U4C3 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31,26■■■□□ 2,6
Scaf1Q5U4C3 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC31,26■■■□□ 2,59
Scaf1Q5U4C3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC31,25■■■□□ 2,59
Scaf1Q5U4C3 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC31,25■■■□□ 2,59
Scaf1Q5U4C3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,24■■■□□ 2,59
Scaf1Q5U4C3 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,24■■■□□ 2,59
Scaf1Q5U4C3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,24■■■□□ 2,59
Scaf1Q5U4C3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,24■■■□□ 2,59
Scaf1Q5U4C3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,23■■■□□ 2,59
Scaf1Q5U4C3 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,22■■■□□ 2,59
Scaf1Q5U4C3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31,22■■■□□ 2,59
Scaf1Q5U4C3 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,2■■■□□ 2,59
Scaf1Q5U4C3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC31,2■■■□□ 2,59
Scaf1Q5U4C3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC31,2■■■□□ 2,58
Scaf1Q5U4C3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31,19■■■□□ 2,58
Scaf1Q5U4C3 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC31,19■■■□□ 2,58
Scaf1Q5U4C3 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,17■■■□□ 2,58
Scaf1Q5U4C3 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC31,17■■■□□ 2,58
Scaf1Q5U4C3 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC31,17■■■□□ 2,58
Scaf1Q5U4C3 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,17■■■□□ 2,58
Scaf1Q5U4C3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,17■■■□□ 2,58
Scaf1Q5U4C3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31,17■■■□□ 2,58
Scaf1Q5U4C3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,17■■■□□ 2,58
Scaf1Q5U4C3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC31,17■■■□□ 2,58
Scaf1Q5U4C3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC31,16■■■□□ 2,58
Scaf1Q5U4C3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,16■■■□□ 2,58
Scaf1Q5U4C3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,16■■■□□ 2,58
Scaf1Q5U4C3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,16■■■□□ 2,58
Scaf1Q5U4C3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC31,16■■■□□ 2,58
Scaf1Q5U4C3 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,15■■■□□ 2,58
Scaf1Q5U4C3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC31,15■■■□□ 2,58
Scaf1Q5U4C3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,15■■■□□ 2,58
Scaf1Q5U4C3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,15■■■□□ 2,58
Scaf1Q5U4C3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,14■■■□□ 2,58
Scaf1Q5U4C3 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,14■■■□□ 2,58
Scaf1Q5U4C3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,13■■■□□ 2,57
Scaf1Q5U4C3 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,13■■■□□ 2,57
Scaf1Q5U4C3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,13■■■□□ 2,57
Scaf1Q5U4C3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,13■■■□□ 2,57
Scaf1Q5U4C3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31,12■■■□□ 2,57
Scaf1Q5U4C3 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC31,12■■■□□ 2,57
Scaf1Q5U4C3 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC31,12■■■□□ 2,57
Scaf1Q5U4C3 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC31,12■■■□□ 2,57
Scaf1Q5U4C3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,11■■■□□ 2,57
Scaf1Q5U4C3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,1■■■□□ 2,57
Scaf1Q5U4C3 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC31,1■■■□□ 2,57
Scaf1Q5U4C3 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC31,1■■■□□ 2,57
Scaf1Q5U4C3 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC31,1■■■□□ 2,57
Scaf1Q5U4C3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31,08■■■□□ 2,57
Scaf1Q5U4C3 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC31,08■■■□□ 2,57
Scaf1Q5U4C3 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,08■■■□□ 2,57
Scaf1Q5U4C3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,07■■■□□ 2,56
Scaf1Q5U4C3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,07■■■□□ 2,56
Scaf1Q5U4C3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC31,07■■■□□ 2,56
Scaf1Q5U4C3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC31,07■■■□□ 2,56
Scaf1Q5U4C3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,06■■■□□ 2,56
Scaf1Q5U4C3 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC31,06■■■□□ 2,56
Scaf1Q5U4C3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,06■■■□□ 2,56
Scaf1Q5U4C3 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC31,06■■■□□ 2,56
Scaf1Q5U4C3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,06■■■□□ 2,56
Scaf1Q5U4C3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,04■■■□□ 2,56
Scaf1Q5U4C3 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,04■■■□□ 2,56
Scaf1Q5U4C3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC31,04■■■□□ 2,56
Scaf1Q5U4C3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,04■■■□□ 2,56
Scaf1Q5U4C3 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC31,04■■■□□ 2,56
Scaf1Q5U4C3 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31,03■■■□□ 2,56
Scaf1Q5U4C3 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC31,03■■■□□ 2,56
Scaf1Q5U4C3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,03■■■□□ 2,56
Scaf1Q5U4C3 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC31,03■■■□□ 2,56
Scaf1Q5U4C3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,03■■■□□ 2,56
Scaf1Q5U4C3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC31,03■■■□□ 2,56
Scaf1Q5U4C3 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC31,02■■■□□ 2,56
Scaf1Q5U4C3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC31,02■■■□□ 2,56
Scaf1Q5U4C3 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,02■■■□□ 2,56
Scaf1Q5U4C3 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC31,01■■■□□ 2,55
Scaf1Q5U4C3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC31,01■■■□□ 2,55
Scaf1Q5U4C3 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,01■■■□□ 2,55
Scaf1Q5U4C3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,01■■■□□ 2,55
Scaf1Q5U4C3 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,01■■■□□ 2,55
Scaf1Q5U4C3 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,01■■■□□ 2,55
Scaf1Q5U4C3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC31,01■■■□□ 2,55
Scaf1Q5U4C3 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2,55
Scaf1Q5U4C3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2,55
Scaf1Q5U4C3 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2,55
Scaf1Q5U4C3 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC30,99■■■□□ 2,55
Scaf1Q5U4C3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC30,99■■■□□ 2,55
Scaf1Q5U4C3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,99■■■□□ 2,55
Scaf1Q5U4C3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,99■■■□□ 2,55
Scaf1Q5U4C3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30,99■■■□□ 2,55
Scaf1Q5U4C3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,99■■■□□ 2,55
Scaf1Q5U4C3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC30,99■■■□□ 2,55
Scaf1Q5U4C3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,98■■■□□ 2,55
Scaf1Q5U4C3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,98■■■□□ 2,55
Scaf1Q5U4C3 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC30,98■■■□□ 2,55
Scaf1Q5U4C3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,98■■■□□ 2,55
Scaf1Q5U4C3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,98■■■□□ 2,55
Scaf1Q5U4C3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC30,97■■■□□ 2,55
Scaf1Q5U4C3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC30,97■■■□□ 2,55
Scaf1Q5U4C3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,97■■■□□ 2,55
Scaf1Q5U4C3 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC30,95■■■□□ 2,55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,7 ms