Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW75

Ssh2, Protein phosphatase Slingshot homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh2Q5SW75 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
Ssh2Q5SW75 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Ssh2Q5SW75 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.13
Ssh2Q5SW75 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
Ssh2Q5SW75 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Ssh2Q5SW75 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
Ssh2Q5SW75 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Ssh2Q5SW75 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
Ssh2Q5SW75 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Ssh2Q5SW75 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Ssh2Q5SW75 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
Ssh2Q5SW75 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Ssh2Q5SW75 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
Ssh2Q5SW75 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
Ssh2Q5SW75 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
Ssh2Q5SW75 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
Ssh2Q5SW75 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC34.49■■■■□ 3.11
Ssh2Q5SW75 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC34.49■■■■□ 3.11
Ssh2Q5SW75 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Ssh2Q5SW75 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
Ssh2Q5SW75 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Ssh2Q5SW75 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Ssh2Q5SW75 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Ssh2Q5SW75 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Ssh2Q5SW75 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC34.46■■■■□ 3.11
Ssh2Q5SW75 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
Ssh2Q5SW75 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Ssh2Q5SW75 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC34.44■■■■□ 3.1
Ssh2Q5SW75 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Ssh2Q5SW75 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Ssh2Q5SW75 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Ssh2Q5SW75 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Ssh2Q5SW75 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Ssh2Q5SW75 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
Ssh2Q5SW75 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Ssh2Q5SW75 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Ssh2Q5SW75 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Ssh2Q5SW75 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
Ssh2Q5SW75 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Ssh2Q5SW75 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Ssh2Q5SW75 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Ssh2Q5SW75 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Ssh2Q5SW75 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
Ssh2Q5SW75 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Ssh2Q5SW75 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Ssh2Q5SW75 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
Ssh2Q5SW75 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Ssh2Q5SW75 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Ssh2Q5SW75 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
Ssh2Q5SW75 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Ssh2Q5SW75 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Ssh2Q5SW75 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
Ssh2Q5SW75 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Ssh2Q5SW75 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
Ssh2Q5SW75 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Ssh2Q5SW75 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Ssh2Q5SW75 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
Ssh2Q5SW75 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Ssh2Q5SW75 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Ssh2Q5SW75 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Ssh2Q5SW75 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Ssh2Q5SW75 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Ssh2Q5SW75 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Ssh2Q5SW75 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
Ssh2Q5SW75 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Ssh2Q5SW75 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Ssh2Q5SW75 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Ssh2Q5SW75 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Ssh2Q5SW75 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC34.33■■■■□ 3.09
Ssh2Q5SW75 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Ssh2Q5SW75 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
Ssh2Q5SW75 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Ssh2Q5SW75 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
Ssh2Q5SW75 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Ssh2Q5SW75 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Ssh2Q5SW75 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Ssh2Q5SW75 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Ssh2Q5SW75 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
Ssh2Q5SW75 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
Ssh2Q5SW75 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Ssh2Q5SW75 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC34.27■■■■□ 3.08
Ssh2Q5SW75 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
Ssh2Q5SW75 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.07
Ssh2Q5SW75 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC34.25■■■■□ 3.07
Ssh2Q5SW75 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
Ssh2Q5SW75 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
Ssh2Q5SW75 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
Ssh2Q5SW75 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Ssh2Q5SW75 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Ssh2Q5SW75 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Ssh2Q5SW75 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Ssh2Q5SW75 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Ssh2Q5SW75 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC34.21■■■■□ 3.07
Ssh2Q5SW75 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Ssh2Q5SW75 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
Ssh2Q5SW75 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Ssh2Q5SW75 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Ssh2Q5SW75 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Ssh2Q5SW75 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Ssh2Q5SW75 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC34.16■■■■□ 3.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.1 ms