Protein–RNA interactions for Protein: Q505F5

Lrrc47, Leucine-rich repeat-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 581 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc47Q505F5 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lrrc47Q505F5 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lrrc47Q505F5 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lrrc47Q505F5 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lrrc47Q505F5 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Lrrc47Q505F5 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lrrc47Q505F5 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lrrc47Q505F5 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Lrrc47Q505F5 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lrrc47Q505F5 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lrrc47Q505F5 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lrrc47Q505F5 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lrrc47Q505F5 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lrrc47Q505F5 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lrrc47Q505F5 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lrrc47Q505F5 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lrrc47Q505F5 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lrrc47Q505F5 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lrrc47Q505F5 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lrrc47Q505F5 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lrrc47Q505F5 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lrrc47Q505F5 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Lrrc47Q505F5 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Lrrc47Q505F5 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Lrrc47Q505F5 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lrrc47Q505F5 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lrrc47Q505F5 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lrrc47Q505F5 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lrrc47Q505F5 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lrrc47Q505F5 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lrrc47Q505F5 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lrrc47Q505F5 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lrrc47Q505F5 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lrrc47Q505F5 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lrrc47Q505F5 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Lrrc47Q505F5 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lrrc47Q505F5 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lrrc47Q505F5 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lrrc47Q505F5 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lrrc47Q505F5 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lrrc47Q505F5 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lrrc47Q505F5 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lrrc47Q505F5 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Lrrc47Q505F5 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lrrc47Q505F5 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lrrc47Q505F5 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lrrc47Q505F5 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lrrc47Q505F5 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lrrc47Q505F5 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lrrc47Q505F5 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Lrrc47Q505F5 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lrrc47Q505F5 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lrrc47Q505F5 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lrrc47Q505F5 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lrrc47Q505F5 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lrrc47Q505F5 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lrrc47Q505F5 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lrrc47Q505F5 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lrrc47Q505F5 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lrrc47Q505F5 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lrrc47Q505F5 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Lrrc47Q505F5 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Lrrc47Q505F5 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lrrc47Q505F5 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lrrc47Q505F5 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Lrrc47Q505F5 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Lrrc47Q505F5 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lrrc47Q505F5 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lrrc47Q505F5 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lrrc47Q505F5 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lrrc47Q505F5 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lrrc47Q505F5 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Lrrc47Q505F5 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lrrc47Q505F5 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lrrc47Q505F5 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lrrc47Q505F5 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lrrc47Q505F5 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lrrc47Q505F5 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lrrc47Q505F5 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lrrc47Q505F5 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lrrc47Q505F5 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lrrc47Q505F5 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lrrc47Q505F5 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lrrc47Q505F5 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lrrc47Q505F5 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Lrrc47Q505F5 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Lrrc47Q505F5 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Lrrc47Q505F5 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Lrrc47Q505F5 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lrrc47Q505F5 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Lrrc47Q505F5 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lrrc47Q505F5 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lrrc47Q505F5 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Lrrc47Q505F5 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lrrc47Q505F5 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lrrc47Q505F5 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lrrc47Q505F5 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lrrc47Q505F5 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lrrc47Q505F5 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lrrc47Q505F5 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
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